VIP20
本课程属于：023-NGS变异流程批次质控 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

NGS多批次测序质控故障诊断与溯源

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
NGS批次质控概述
为什么要做批次质控
NGS批次质控概述
02
批次质控流程总览
从样本到报告
批次质控流程总览从样本到报告
03
常见测序平台介绍
Illumina · MGI · ONT
常见测序平台介绍Illumina
04
批次效果评估指标
Q30 · 碱基分布 · duplicate rate
批次效果评估指标Q30
05
样本接收时批次标识与记录规范
样本接收时批次标识与记录规范 · 核心概念 · 实践要点
样本接收时批次标…记录规范
06
文库浓度与片段分布质控
文库浓度与片段分布质控 · 核心概念 · 实践要点
文库浓度片段分布质控
07
文库接头二聚体检测与处理
文库接头二聚体检测与处理 · 核心概念 · 实践要点
文库接头二聚体检…处理
08
PCR扩增偏差对批次的影响
PCR扩增偏差对批次的影响 · 核心概念 · 实践要点
PCR扩增偏差对批次的…
09
批次间测序通量差异排查
批次间测序通量差异排查 · 核心概念 · 实践要点
批次间测序通量差…重点
10
簇密度与簇识别质量控制
簇密度与簇识别质量控制 · 核心概念 · 实践要点
簇密度簇识别质量控制
11
测序读长与质量分数分布分析
测序读长与质量分数分布分析 · 核心概念 · 实践要点
测序读长质量分数分布分析
12
Index hopping与样本交叉污染排查
Index hopping与样本交叉污染… · 核心概念 · 实践要点
Indexhopping
13
UMI正确使用与批次内一致性
UMI正确使用与批次内一致性 · 核心概念 · 实践要点
UMI正确使用
14
数据下机后FASTQ质量汇总
数据下机后FASTQ质量汇总 · 核心概念 · 实践要点
FASTQ数据下机后
15
FastQC与MultiQC批次报告解读
FastQC与MultiQC批次报告解读 · 核心概念 · 实践要点
FastQCMultiQC
16
GC异常分布批次间一致性检查
GC异常分布批次间一致性检查 · 核心概念 · 实践要点
GC异常分布批次间一…
17
序列比对率与比对质量批次统计
序列比对率与比对质量批次统计 · 核心概念 · 实践要点
序列比对率比对质量批次统计
18
重复率过高原因分析与处理
重复率过高原因分析与处理 · 核心概念 · 实践要点
重复率过高原因分…处理
19
基因组覆盖度均一性批次比较
基因组覆盖度均一性批次比较 · 核心概念 · 实践要点
基因组覆盖度均一…重点
20
SNP/INDEL检测批次效应排查
SNP/INDEL检测批次效应排查 · 核心概念 · 实践要点
SNP/INDEL检测批次效应排查
21
RNA-seq批次效应
基因表达量波动
RNA-seq批次效应
22
批次间差异表达基因假阳性排查
批次间差异表达基因假阳性排查 · 核心概念 · 实践要点
批次间差异表达基…重点
23
基于PCA/UMAP的批次可视化检测
基于PCA/UMAP的批次可视化检测 · 核心概念 · 实践要点
PCA/UMAP基于
24
使用ComBat/Limma等工具校正批次效应
使用ComBat/Limma等工具校正批… · 核心概念 · 实践要点
ComBat/Limma使用
25
样本置换/混淆问题排查与追溯
样本置换/混淆问题排查与追溯 · 核心概念 · 实践要点
样本置换混淆问题排查
26
试剂批次变更对质控的影响
试剂批次变更对质控的影响 · 核心概念 · 实践要点
试剂批次变更对质…重点
27
操作人员不同导致的系统误差
操作人员不同导致的系统误差 · 核心概念 · 实践要点
操作人员不同导致…重点
28
批次质控报告自动化生成（Python/R脚本）
批次质控报告自动化生成（Python/R… · 核心概念 · 实践要点
Python/R批次质控报告自动…
29
典型案例分析一
文库浓度低导致数据量不足
典型案例分析一文库浓度低导致数…
30
典型案例分析二
PCR重复率过高导致变异检测偏差
典型案例分析二PCR