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生物技术_生物工程与智能实验室
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030-生物信息工作流与AI辅助实验
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《AI辅助生物实验设计工程》
VIP14
本课程属于:030-生物信息工作流与AI辅助实验
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AI辅助生物实验设计工程
共计 30 章节
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01
课程导入
目标=AI辅助生物实验设计工程的定义 · 核心价值 · 典型应用场景与完整工作流概览
课程导入
AI
02
实验设计对象建模
目标=将生物学问题转化为可计算的设计… · 约束条件 · 目标函数与评价指标
实验设计对象建模
目标=将生物学问…
03
生物实验数据基础
目标=常用数据类型 · 数据来源 · 质量控制
生物实验数据基础
目标=常用数据类…
04
实验设计中的统计与机器学习基础
目标=假设检验 · 回归 · 分类
实验设计
统计
05
实验空间与搜索策略
目标=组合空间 · 连续空间 · 混合空间的定义
实验空间
搜索策略
06
贝叶斯优化与主动学习
目标=代理模型 · 采集函数 · 批次实验选择与实验轮次迭代设计
贝叶斯优化
主动学习
07
实验约束与可行性建模
目标=生物学约束 · 资源约束 · 安全约束
实验约束
可行性建模
08
AI辅助分子与菌株设计
目标=序列 · 结构 · 通路与表型之间的预测模型及其在实验设…
AI
辅助分子
09
AI辅助培养条件与工艺优化
目标=培养基 · 温度 · pH
AI
辅助培养条件
10
AI辅助基因编辑实验设计
目标=sgRNA设计 · 脱靶预测 · 编辑效率预测与验证实验的联合规划
AI
辅助基因编辑实验…
11
AI辅助蛋白质工程实验设计
目标=突变文库设计 · 稳定性与活性预测 · 定向进化轮次决策
AI
辅助蛋白质工程实…
12
AI辅助合成生物学线路设计
目标=基因线路 · 启动子 · RBS
AI
辅助合成生物学线…
13
AI辅助药物筛选实验设计
目标=化合物库设计 · 活性与毒性预测 · 剂量-反应实验与联合用药方案
AI
辅助药物筛选实验…
14
AI辅助细胞实验设计
目标=细胞系选择 · 处理条件 · 时间点
AI
辅助细胞实验设计
15
AI辅助动物实验设计
目标=分组 · 剂量 · 给药方案
AI
辅助动物实验设计
16
AI辅助多组学实验设计
目标=转录组 · 蛋白组 · 代谢组等联合实验的采样
AI
辅助多组学实验设…
17
实验设计中的不确定性与鲁棒性
目标=噪声建模 · 置信区间 · 鲁棒优化与失败实验的利用策略
实验设计
不确定性
18
实验设计中的迁移与泛化
目标=跨细胞 · 跨物种 · 跨平台数据下的模型迁移与实验外推风险…
实验设计
迁移
19
实验设计中的因果推断
目标=从观察数据到干预实验 · 因果图 · do演算与实验验证设计
实验设计
因果推断
20
AI辅助实验方案生成与文档化
目标=从设计目标到可执行protoc… · 审查与版本管理
AI
辅助实验方案生成
21
实验执行与自动化集成
目标=液体处理工作站 · 微流控 · 机器人平台与AI设计闭环的接口设计
实验执行
自动化集成
22
实验数据回流与模型迭代
目标=实验执行结果的结构化记录 · 模型更新 · 主动再设计与闭环优化
实验数据回流
模型迭代
23
实验设计中的可重复性与可复现性
目标=随机种子 · 环境记录 · 代码与数据版本
实验设计
可重复性
24
AI辅助实验设计的评估方法
目标=基准任务 · 评价指标 · 消融实验
AI
辅助实验设计的评…
25
AI辅助实验设计的失败模式
目标=数据泄漏 · 过拟合 · 分布偏移
AI
辅助实验设计的失…
26
真实案例一
目标=AI辅助定向进化实验设计全流程 · 从突变文库到多轮筛选决策
真实案例一
AI
27
真实案例二
目标=AI辅助药物组合筛选实验设计 · 从细胞实验到剂量优化与验证
真实案例二
AI
28
真实案例三
目标=AI辅助合成生物学底盘细胞优化 · 从通路设计到发酵条件联合优化
真实案例三
AI
29
工程化实战
目标=搭建一个AI辅助生物实验设计的… · 包含建模 · 推荐
工程化实战
AI
30
综合项目与前沿展望
目标=面向真实课题完成端到端实验设计… · 并讨论自动化 · 大模型与自主实验室趋势
综合项目
前沿展望
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同VIP:Snakemake组学流程工程
同VIP:多组学数据整合分析工程