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迁移学习在相互作用预测中的应用

共计 30 章节
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01
迁移学习概述
定义 · 发展历程 · 在生物信息学中的重要性
迁移学习概述定义
02
相互作用预测简介
蛋白质-蛋白质相互作用 · 药物-靶标相互作用等
相互作用预测简介蛋白质
03
传统机器学习方法在相互作用预测中的应用。
传统机器学习方法在相互作用预测中的应用 · 核心概念 · 实践要点
传统机器学习方法相互作用预测
04
深度学习基础
前馈网络 · 卷积网络 · 循环网络
深度学习基础前馈网络
05
迁移学习的核心概念
源域 · 目标域 · 任务
迁移学习的核心概…源域
06
迁移学习的分类
归纳迁移 · 直推式迁移 · 无监督迁移
迁移学习的分类归纳迁移
07
特征迁移
域自适应 · 最大均值差异 · 对抗性训练
特征迁移域自适应
08
参数迁移
共享参数 · 微调 · 元学习
参数迁移共享参数
09
关系迁移
知识图谱 · 图结构迁移
关系迁移知识图谱
10
预训练模型在序列数据中的应用
BERT · Transformer
预训练模型序列数据
11
蛋白质序列表示的预训练模型
ProtBERT · ESM · TAPE
蛋白质序列表示的…ProtBERT
12
图神经网络与分子图
GCN · GAT · MPNN
图神经网络分子图
13
图表示学习与迁移
预训练分子图模型
图表示学习迁移
14
跨物种相互作用预测的迁移学习。
跨物种相互作用预测的迁移学习 · 核心概念 · 实践要点
跨物种相互作用预…重点
15
小样本学习与迁移学习
小样本药物发现
小样本学习迁移学习
16
多任务学习与迁移学习的关系。
多任务学习与迁移学习的关系 · 核心概念 · 实践要点
多任务学习迁移学习的关系
17
对抗性域自适应在相互作用预测中的应用。
对抗性域自适应在相互作用预测中的应用 · 核心概念 · 实践要点
对抗性域自适应相互作用预测
18
自蒸馏和知识蒸馏在迁移学习中的作用。
自蒸馏和知识蒸馏在迁移学习中的作用 · 核心概念 · 实践要点
自蒸馏知识蒸馏
19
数据增强与无监督预训练。
数据增强与无监督预训练 · 核心概念 · 实践要点
数据增强无监督预训练
20
案例研究
使用ESM迁移到PPI预测
案例研究ESM
21
案例研究
Drug-Target Intera…
案例研究Drug-Target
22
评价指标与基准数据集
HumanPPI · BioNE · BindingDB等
评价指标基准数据集
23
迁移学习中的负面迁移与避免方法。
迁移学习中的负面迁移与避免方法 · 核心概念 · 实践要点
迁移学习负面迁移
24
模型解释性在迁移学习中的应用。
模型解释性在迁移学习中的应用 · 核心概念 · 实践要点
模型解释性迁移学习
25
多模态相互作用预测中的迁移学习。
多模态相互作用预测中的迁移学习 · 核心概念 · 实践要点
多模态相互作用预…迁移学习
26
实时交互预测的迁移学习加速。
实时交互预测的迁移学习加速 · 核心概念 · 实践要点
实时交互预测的迁…重点
27
联邦学习与隐私保护下的迁移。
联邦学习与隐私保护下的迁移 · 核心概念 · 实践要点
联邦学习隐私保护下的迁移
28
未来方向
大语言模型与生物交互预测
未来方向大语言模型
29
实践项目
基于迁移学习的药物重定位预测
实践项目基于迁移学习的药…
30
总结与展望。
总结与展望 · 核心概念 · 实践要点
总结与展望重点