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分子指纹在药物筛选中的应用实践

共计 30 章节
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01
课程导论
分子指纹与药物筛选概述 · 课程目标与学习路径
课程导论分子指纹
02
药物筛选基础
靶点识别 · 高通量筛选与虚拟筛选简介
药物筛选基础靶点识别
03
分子表示方法
SMILES · InChI · 分子图与分子指纹概念
分子表示方法SMILES
04
化学信息学工具
RDKit安装与基本使用 · 分子读取与操作
化学信息学工具RDKit
05
分子指纹原理
哈希编码 · 位向量与特征映射
分子指纹原理哈希编码
06
结构指纹
MACCS keys 详解与实现
结构指纹MACCS
07
拓扑指纹
ECFP（扩展连通性指纹）原理与参数
拓扑指纹ECFP
08
摩根指纹
圆形指纹与半径选择
摩根指纹圆形指纹
09
其他常见指纹
FCFP · AP · Torsion
其他常见指纹FCFP
10
指纹生成实战
使用RDKit生成MACCS · ECFP · 摩根指纹
指纹生成实战RDKit
11
相似性度量
Tanimoto系数 · Dice系数 · Cosine相似度
相似性度量Tanimoto
12
相似性搜索
基于指纹的最近邻搜索与库比对
相似性搜索基于指纹的最近邻…
13
分子多样性分析
指纹主成分分析 · t-SNE可视化
分子多样性分析指纹主成分分析
14
药效团映射
基于指纹的药效团特征提取
药效团映射基于指纹的药效团…
15
QSAR建模基础
定量构效关系与分子描述符
QSAR建模基础
16
分子指纹与机器学习
特征工程与模型选择
分子指纹机器学习
17
分类模型
使用指纹训练分类器（SVM · 随机森林等）
分类模型SVM
18
回归模型
预测活性值或ADME性质
回归模型ADME
19
深度学习与分子指纹
图神经网络与自动编码器
深度学习分子指纹
20
模型评估
交叉验证 · AUC · 混淆矩阵
模型评估交叉验证
21
虚拟筛选流程
从靶点到候选化合物的完整管线
虚拟筛选流程从靶点到候选化合…
22
基于配体的虚拟筛选
相似性搜索与药效团筛选
基于配体的虚拟筛…相似性搜索
23
基于结构的虚拟筛选
分子对接与指纹结合
基于结构的虚拟筛…分子对接
24
命中化合物验证
聚类分析 · 选择代表性分子
化合物验证聚类分析
25
案例实战1
使用ChEMBL数据集进行活性化合物…
案例实战1ChEMBL
26
案例实战2
针对特定靶点（如SARS-CoV-2…
案例实战2SARS-CoV-2
27
案例实战3
ADMET性质预测与分子指纹组合
案例实战3ADMET
28
结果解析与可视化
热图 · 散点图与交互式仪表盘
结果解析可视化
29
常见问题与优化
指纹长度 · 哈希冲突 · 计算性能
常见问题优化
30
课程总结与未来展望
分子指纹新趋势与AI制药
课程总结未来展望