VIP20
本课程属于：018-药物靶点知识图谱 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

VCF变异数据整合知识图谱实战

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
VCF格式详解
结构 · 字段与规范
VCF格式详解
02
变异数据获取
常用数据库与下载方法
变异数据获取常用数据库
03
VCF文件解析
Python库与自定义解析
VCF文件解析
04
变异注释基础
ANNOVAR · SnpEff等工具使用
变异注释基础ANNOVAR
05
变异注释进阶
VEP · Funcotator集成
变异注释进阶VEP
06
多VCF文件合并
策略与注意事项
VCF文件合并
07
变异数据质量控制
过滤与标准化
变异数据质量控制过滤
08
变异频率整合
gnomAD · 千人基因组数据融合
变异频率整合gnomAD
09
临床变异数据库整合
ClinVar · COSMIC
临床变异数据库整…ClinVar
10
基因-疾病关联数据整合
DisGeNET · OMIM
基因疾病关联数据整合
11
蛋白质相互作用数据整合
STRING · BioGRID
蛋白质相互作用数…STRING
12
通路数据整合
KEGG · Reactome
通路数据整合KEGG
13
知识图谱基础
RDF · 属性图模型选择
知识图谱基础RDF
14
Neo4j图数据库
安装 · 配置与Cypher入门
Neo4j图数据库
15
Neo4j数据导入
从VCF到图模型映射
Neo4j数据导入
16
节点设计
变异 · 基因 · 疾病
节点设计变异
17
关系设计
变异-基因关联 · 基因-疾病关联等
关系设计变异
18
使用py2neo构建图数据库
使用py2neo构建图数据库 · 核心概念 · 实践要点
py2neo使用
19
数据清洗与去重
实体对齐技术
数据清洗去重
20
知识图谱查询
基于Cypher的变异查询
知识图谱查询Cypher
21
知识图谱可视化
Neovis.js与D3.js
知识图谱可视化Neovis.js
22
图谱推理
基于规则的变异致病性推断
图谱推理基于规则的变异致…
23
机器学习与图神经网络
GCN应用于变异优先级
机器学习图神经网络
24
图数据库性能优化
索引 · 批处理
图数据库性能优化索引
25
大规模变异数据整合
Spark与分布式处理
大规模变异数据整…Spark
26
实战项目
肿瘤体细胞变异知识图谱构建
实战项目肿瘤体细胞变异知…
27
实战项目
遗传病罕见变异分析图谱
实战项目遗传病罕见变异分…
28
知识图谱的API服务
Flask+Neo4j
API知识图谱的
29
知识图谱的版本管理与更新
知识图谱的版本管理与更新 · 核心概念 · 实践要点
知识图谱的版本管…更新
30
总结与展望
精准医学中的知识图谱
精准医学知识图谱