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Neo4j药物靶点知识图谱构建与查询优化

共计 30 章节
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01
Neo4j简介
图数据库概念 · Neo4j特点 · 应用场景（药物发现）
Neo4j简介
02
Cypher基础
CREATE · MATCH · RETURN等基本操作
CypherCREATE
03
节点与关系属性
设置属性 · 多属性 · 索引
节点关系属性
04
药物靶点数据模型
药物节点 · 靶点节点 · 相互作用关系
药物靶点数据模型药物节点
05
从原始数据导入
CSV导入 · LOAD CSV命令
从原始数据导入CSV
06
数据清洗与预处理
使用Python处理药物靶点数据
数据清洗预处理
07
创建约束和索引
唯一性约束 · 全文索引
创建约束索引
08
复杂查询
WHERE · ORDER BY · 聚合函数
复杂查询WHERE
09
路径查询
关系方向 · 可变长度路径
路径查询关系方向
10
子图查询
WITH · UNWIND · FOREACH
子图查询WITH
11
图模式匹配
节点模式 · 关系模式
图模式匹配节点模式
12
药物-靶点关联分析
查询与统计
药物靶点关联分析
13
药物相似性计算
基于靶点重叠的Jaccard相似度
药物相似性计算Jaccard
14
靶点聚类
社区检测算法（Louvain）
靶点聚类Louvain
15
最短路径分析
药物到疾病靶点
最短路径分析药物到疾病靶点
16
推荐系统
基于图的协同过滤
推荐系统基于图的协同过滤
17
可视化工具
Neo4j Browser · Neovis.js
可视化工具Neo4j
18
生物网络集成
加入蛋白质-蛋白质相互作用数据
生物网络集成加入蛋白质
19
通路数据集成
KEGG · Reactome
通路数据集成KEGG
20
药物副作用的图建模。
药物副作用的图建模 · 核心概念 · 实践要点
药物副作用的图建…重点
21
时序数据
药物相互作用随时间变化
时序数据药物相互作用随时…
22
图算法集成
使用Neo4j GDS库
图算法集成Neo4j
23
中心性分析
度中心性 · 介数中心性
心性分析心性
24
社区检测在实际药物发现中的应用。
社区检测在实际药物发现中的应用 · 核心概念 · 实践要点
社区检测实际药物发现
25
知识图谱查询优化
索引 · 查询计划
知识图谱查询优化索引
26
大规模图存储
分片 · 集群
大规模图存储分片
27
备份与恢复
事务日志
备份恢复
28
安全与权限管理。
安全与权限管理 · 核心概念 · 实践要点
安全权限管理
29
与机器学习结合
图嵌入（Node2Vec）
机器学习结合Node2Vec
30
案例实战
构建一个完整的药物靶点知识图谱应用
案例实战构建一个完整的药…