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药物靶点预测与ADME评估管线构建

共计 30 章节
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01
药物靶点Pipeline概述
药物靶点Pipeline概述 · 核心概念 · 实践要点
Pipeline药物靶点
02
生物信息学基础
基因组 · 转录组 · 蛋白质组
生物信息学基础基因组
03
靶点识别策略
从疾病机制到候选靶点
靶点识别策略从疾病机制到候选…
04
公共数据库使用
UniProt · PDB · ChEMBL
公共数据库使用UniProt
05
数据获取与格式转换
FASTA · PDB · SDF
数据获取格式转换
06
序列比对基础
BLAST · ClustalW
序列比对基础BLAST
07
蛋白质结构预测
同源建模（Modeller）
蛋白质结构预测Modeller
08
蛋白质结构预测
AlphaFold2
蛋白质结构预测AlphaFold2
09
结构评估与可视化
PyMOL · VMD
结构评估可视化
10
活性位点识别与配体结合口袋分析
活性位点识别与配体结合口袋分析 · 核心概念 · 实践要点
活性位点识别配体结合口袋分析
11
分子对接原理
刚性对接 vs 柔性对接
分子对接原理vs
12
分子对接实战
AutoDock Vina
分子对接实战AutoDock
13
对接结果分析与筛选
对接结果分析与筛选 · 核心概念 · 实践要点
对接结果分析筛选
14
虚拟筛选
基于结构的虚拟筛选
虚拟筛选基于结构的虚拟筛…
15
虚拟筛选
基于配体的虚拟筛选
虚拟筛选基于配体的虚拟筛…
16
药效团模型构建与应用
药效团模型构建与应用 · 核心概念 · 实践要点
药效团模型构建应用
17
ADME毒性预测
SwissADME · ADMETLab
ADME毒性预测
18
分子动力学模拟入门
GROMACS
分子动力学模拟入…GROMACS
19
分子动力学模拟进阶
轨迹分析
分子动力学模拟进…轨迹分析
20
结合自由能计算
MM-PBSA
结合自由能计算MM-PBSA
21
机器学习在靶点发现中的应用
机器学习在靶点发现中的应用 · 核心概念 · 实践要点
机器学习靶点发现
22
深度学习模型
图神经网络预测药物-靶点相互作用
深度学习模型图神经网络预测药…
23
大规模数据整合与自动化Pipeline构建
大规模数据整合与自动化Pipeline构… · 核心概念 · 实践要点
Pipeline大规模数据整合
24
工作流管理
Snakemake/Nextflow
工作流管理Snakemake/Ne…
25
高性能计算与云平台部署
高性能计算与云平台部署 · 核心概念 · 实践要点
高性能计算云平台部署
26
Pipeline测试与结果验证
Pipeline测试与结果验证 · 核心概念 · 实践要点
Pipeline测试
27
案例实战
针对特定疾病靶点的完整Pipelin…
案例实战Pipelin
28
结果解读与可视化报告生成
结果解读与可视化报告生成 · 核心概念 · 实践要点
结果解读可视化报告生成
29
常见错误与调试技巧
常见错误与调试技巧 · 核心概念 · 实践要点
常见错误调试技巧
30
总结与进阶方向
总结与进阶方向 · 核心概念 · 实践要点
进阶方向总结与进阶方向