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生物信息学与 AI 制药工程
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018-药物靶点知识图谱
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《文献知识抽取与知识图谱自动构建》
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文献知识抽取与知识图谱自动构建
共计 30 章节
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01
文献抽取概述
背景 · 意义 · 知识图谱简介
文献抽取概述
背景
02
文本获取
Web爬虫基础 · 学术API使用
文本获取
Web
03
文本预处理
分词 · 词性标注 · 去除停用词
文本预处理
分词
04
命名实体识别(NER)
基于规则 · 基于统计 · 基于深度学习
NER
命名实体识别
05
关系抽取(RE)
模板匹配 · 远程监督 · 联合抽取
RE
关系抽取
06
知识图谱构建流程
实体对齐 · 实体链接 · 知识融合
知识图谱构建流程
实体对齐
07
知识表示
RDF · 属性图 · OWL
知识表示
RDF
08
知识存储
Neo4j · JanusGraph · RDF存储
知识存储
Neo4j
09
SPARQL查询语言
SPARQL查询语言 · 核心概念 · 实践要点
SPARQL
查询语言
10
知识图谱可视化
D3.js · Cytoscape
知识图谱可视化
D3.js
11
文献元数据提取
标题 · 作者 · 摘要
文献元数据提取
标题
12
引用关系抽取
引文网络构建
引用关系抽取
引文网络构建
13
实体消歧
作者消歧 · 机构消歧
实体消歧
作者消歧
14
事件抽取
触发词识别 · 论元抽取
事件抽取
触发词识别
15
时序关系抽取
时间表达式 · 事件顺序
时序关系抽取
时间表达式
16
多模态文献抽取
图表 · 公式 · 代码
多模态文献抽取
图表
17
跨语言文献抽取
中英文实体对齐
跨语言文献抽取
英文实体对齐
18
大规模数据处理
Spark · 分布式
大规模数据处理
Spark
19
评估与验证
NER评估 · RE评估 · F1等
评估
验证
20
工具与框架
Stanford CoreNLP · spaCy · AllenNLP
工具
框架
21
深度学习模型
BiLSTM-CRF · Transformer
深度学习模型
BiLSTM-CRF
22
预训练语言模型
BERT · ERNIE在NER/RE中的应用
预训练语言模型
BERT
23
图神经网络在知识图谱中的应用
图神经网络在知识图谱中的应用 · 核心概念 · 实践要点
图神经网络
知识图谱
24
知识图谱推理
路径排序 · 嵌入
知识图谱推理
路径排序
25
文献知识图谱的更新与维护
文献知识图谱的更新与维护 · 核心概念 · 实践要点
文献知识图谱的更…
维护
26
案例
生物医学文献知识图谱构建
案例
生物医学文献知识…
27
案例
计算机科学文献知识图谱
案例
计算机科学文献知…
28
案例
专利文献知识抽取
案例
专利文献知识抽取
29
知识图谱问答(KGQA)在文献检索中的应用
知识图谱问答(KGQA)在文献检索中的应… · 核心概念 · 实践要点
KGQA
知识图谱问答
30
总结与展望
未来趋势 · 挑战
未来趋势
挑战
所属VIP或分类
同VIP:BioBERT药物靶点关系抽取与分类
同VIP:Neo4j药物靶点知识图谱构建与查询优化
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