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WDL多任务工作流开发与资源调度

共计 30 章节
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01
WDL简介与应用场景
WDL简介与应用场景 · 核心概念 · 实践要点
WDL简介
02
安装Cromwell与MiniWDL
安装Cromwell与MiniWDL · 核心概念 · 实践要点
CromwellMiniWDL
03
WDL基本语法
workflow和task
WDL基本语法
04
数据类型
String · Int · Float
数据类型String
05
数据类型
File · Array · Map
数据类型File
06
表达式与操作符
表达式与操作符 · 核心概念 · 实践要点
表达式操作符
07
任务命令块（command）编写
任务命令块（command）编写 · 核心概念 · 实践要点
command任务命令块
08
运行时（runtime）声明
运行时（runtime）声明 · 核心概念 · 实践要点
runtime运行时
09
输出块（output）与文件重命名
输出块（output）与文件重命名 · 核心概念 · 实践要点
output输出块
10
工作流输入输出
工作流输入输出 · 核心概念 · 实践要点
工作流输入输出重点
11
数据传递
Call语句
数据传递Call
12
Scatter并行化
Scatter并行化 · 核心概念 · 实践要点
Scatter并行化
13
条件语句（if-else）
条件语句（if-else） · 核心概念 · 实践要点
if-else条件语句
14
参数元数据（parameter_meta）与文档
参数元数据（parameter_meta… · 核心概念 · 实践要点
parametermeta
15
元数据（meta）定义
元数据（meta）定义 · 核心概念 · 实践要点
meta元数据
16
导入其他WDL文件（import）
导入其他WDL文件（import） · 核心概念 · 实践要点
WDLimport
17
别名（alias）与重定向
别名（alias）与重定向 · 核心概念 · 实践要点
alias别名
18
自定义数据结构（struct）
自定义数据结构（struct） · 核心概念 · 实践要点
struct自定义数据结构
19
数组操作与索引
数组操作与索引 · 核心概念 · 实践要点
数组操作索引
20
Map操作与查找
Map操作与查找 · 核心概念 · 实践要点
Map操作
21
Pair类型使用场景
Pair类型使用场景 · 核心概念 · 实践要点
Pair类型使用场景
22
通配符与文件集合
通配符与文件集合 · 核心概念 · 实践要点
通配符文件集合
23
环境变量与全局设置
环境变量与全局设置 · 核心概念 · 实践要点
环境变量全局设置
24
Docker与容器化执行
Docker与容器化执行 · 核心概念 · 实践要点
Docker容器化执行
25
资源配额与调度
资源配额与调度 · 核心概念 · 实践要点
资源配额调度
26
错误处理与重试机制
错误处理与重试机制 · 核心概念 · 实践要点
错误处理重试机制
27
调试工具
womtool与validate
调试工具womtool
28
性能优化与缓存策略
性能优化与缓存策略 · 核心概念 · 实践要点
性能优化缓存策略
29
实战
RNA-seq定量分析流程
RNA-seq定量分析流程
30
实战
全基因组变异检测流程
全基因组变异检测…重点