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Cromwell混合云工作流迁移与验证

共计 30 章节

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什么是Cromwell · 核心概念 · 工作流WDL介绍

混合云基础

混合云架构 · 迁移必要性 · 常见挑战

混合云基础混合云架构

本地Docker · Cromwell安装 · 虚拟机设置

环境准备Docker

配置云提供者

AWS · Azure · GCP配置入门

配置云提供者AWS

数据存储与传输

S3 · Blob Storage · GS对象存储配置

数据存储传输

工作流编写入门

WDL语法基础 · 任务与工作流

工作流编写入门WDL

工作流中的容器化

Docker镜像 · 端口映射 · 资源请求

工作流容器化

定向到云执行

Cromwell的后端选择（Loca… · Batch · PBS等）

定向到云执行Cromwell

使用Cromwell on Cloud

Terra · FireCloud集成

评估现有工作流 · 依赖分析

迁移策略评估现有工作流

从NAS/本地对象存储同步到云

数据迁移NAS

身份与权限管理

IAM角色 · 服务账号 · 访问密钥

身份权限管理

网络与安全

VPC配置 · 防火墙规则 · 数据传输加密

批处理作业配置

AWS Batch / Azure…

批处理作业配置AWS

监控与日志

CloudWatch · Azure Monitor · Stackdriver集成

定价模型 · 资源优化 · 预留实例

成本管理定价模型

并行度 · 内存调整 · 缓存策略

性能优化并行度

常见错误排查 · 重试机制 · 人工干预

故障处理常见错误排查

版本控制与CI/CD

Git仓库管理 · 自动测试 · 部署流水线

CI/CD版本控制

混合云双活架构

同时使用本地和云端计算资源

混合云双活架构同时使用本地

工作流管理最佳实践

命名规范 · 输入输出标准化

工作流管理最佳实…命名规范

使用预置AWS Batch环境

创建Compute Environm… · Job Queue

使用Azure Batch自定义镜像

准备Docker镜像 · Pool配置

使用Google Cloud Life Sciences API

取代传统Batch

迁移后的验证

测试 · 回滚计划 · 性能对比

迁移后的验证测试

合规与数据主权

数据驻留要求 · 审计日志

合规数据主权

自动化迁移工具

基于脚本的迁移 · 基础设施即代码（Terraform）

自动化迁移工具基于脚本的迁移

基因组分析工作流迁移经验分享

案例研究基因组分析工作流…

使用Cromwell REST AP…

Serverless Cromwel… · Kubernetes集成

未来趋势Serverless