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本课程属于：009-Visium空间转录组聚类 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
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Visium聚类容器化部署实践指南

共计 30 章节
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01
Visium技术简介与发展历程
Visium技术简介与发展历程 · 核心概念 · 实践要点
Visium技术简介
02
Visium数据分析流程概述
Visium数据分析流程概述 · 核心概念 · 实践要点
Visium数据分析流程概述
03
空间转录组数据格式介绍（H5、mtx、TIFF）
空间转录组数据格式介绍（H5 · 核心概念 · 实践要点
H5mtx
04
聚类算法基础
K-means · Louvain · Leiden
聚类算法基础K-means
05
环境准备
Python · R · Conda环境搭建
环境准备Python
06
Docker基础
安装与常用命令
Docker安装
07
Dockerfile编写
构建分析环境
Dockerfile编写
08
容器化Visium分析工具
Seurat · Scanpy
Visium容器化
09
Multi-stage构建优化镜像大小
Multi-stage构建优化镜像大小 · 核心概念 · 实践要点
Multi-stage构建优化镜像大小
10
Docker Compose编排多服务
Docker Compose编排多服务 · 核心概念 · 实践要点
DockerCompose
11
私有镜像仓库搭建（Harbor）
私有镜像仓库搭建（Harbor） · 核心概念 · 实践要点
Harbor私有镜像仓库搭建
12
Kubernetes架构与核心概念
Kubernetes架构与核心概念 · 核心概念 · 实践要点
Kubernetes架构
13
Minikube/K3s本地部署开发环境
Minikube/K3s本地部署开发环境 · 核心概念 · 实践要点
Minikube/K3s本地部署开发环境
14
Kubectl常用操作与Pod管理
Kubectl常用操作与Pod管理 · 核心概念 · 实践要点
KubectlPod
15
部署Visium分析Job（Job/CronJob）
部署Visium分析Job（Job/Cr… · 核心概念 · 实践要点
VisiumJob
16
ConfigMap与Secret管理配置
ConfigMap与Secret管理配置 · 核心概念 · 实践要点
ConfigMapSecret
17
PV/PVC持久化数据卷
PV/PVC持久化数据卷 · 核心概念 · 实践要点
PV/PVC持久化数据卷
18
Ingress与服务暴露
Ingress与服务暴露 · 核心概念 · 实践要点
Ingress服务暴露
19
ClusterAutoscaler与资源管理
ClusterAutoscaler与资源… · 核心概念 · 实践要点
ClusterAutos…资源管理
20
Helm Charts封装应用
Helm Charts封装应用 · 核心概念 · 实践要点
HelmCharts
21
GitOps
ArgoCD持续部署
GitOpsArgoCD
22
日志收集与监控（ELK/Prometheus）
日志收集与监控（ELK/Promethe… · 核心概念 · 实践要点
ELK/Promethe…日志收集
23
容器安全实践
镜像扫描 · Pod安全策略
容器安全实践镜像扫描
24
性能优化
GPU/NPU加速容器化
性能优化GPU/NPU
25
大规模集群
部署多个Visium样本批处理
大规模集群Visium
26
灾备与恢复策略
灾备与恢复策略 · 核心概念 · 实践要点
灾备恢复策略
27
成本控制与资源配额
成本控制与资源配额 · 核心概念 · 实践要点
成本控制资源配额
28
自动化测试
集成测试与端到端测试
自动化测试集成测试
29
生产环境CI/CD流水线设计
生产环境CI/CD流水线设计 · 核心概念 · 实践要点
CI/CD生产环境
30
总结与最佳实践
总结与最佳实践 · 核心概念 · 实践要点
最佳实践总结与最佳实践