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本课程属于：028-蛋白结构预测与序列智能工程 生命科学与数字医疗 · 共 10 门相关课程，组合学习更完整。
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蛋白突变稳定性预测工程

共计 30 章节
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01
蛋白突变稳定性预测工程导论
目标=课程定位 · 核心问题 · 工程化流程与典型应用场景
蛋白突变稳定性预…目标=课程定位
02
蛋白质稳定性基础
目标=热力学稳定性 · 折叠自由能 · ΔΔG定义及其与突变效应的关系
蛋白质稳定性基础目标=热力学稳定…
03
突变类型与稳定性效应
目标=点突变 · 插入缺失 · 截短突变对结构稳定性的影响规律
突变类型稳定性效应
04
实验测定稳定性数据
目标=热变性 · 化学变性 · 圆二色谱等方法及公共数据库数据获取
实验测定稳定性数…目标=热变性
05
稳定性预测数据集构建
目标=数据清洗 · 去冗余 · 标签标准化与负样本设计
稳定性预测数据集…目标=数据清洗
06
特征工程基础
目标=序列 · 结构 · 进化与物理化学特征提取方法
特征工程基础目标=序列
07
序列保守性与进化特征
目标=多序列比对 · 位置特异性打分矩阵 · 共进化信息提取
序列保守性进化特征
08
结构特征提取
目标=溶剂可及性 · 二级结构 · 接触数
结构特征提取目标=溶剂可
09
物理化学描述符
目标=疏水性 · 电荷 · 体积
物理化学描述符目标=疏水性
10
传统机器学习基线
目标=线性回归 · 支持向量机 · 随机森林在ΔΔG预测中的应用
传统机器学习基线目标=线性回归
11
深度学习入门
目标=全连接网络 · 卷积网络与循环网络处理蛋白序列与结构
深度学习入门目标=全连接网络
12
图神经网络与蛋白结构
目标=以残基为节点 · 空间邻接为边的图表示学习
图神经网络蛋白结构
13
预训练蛋白语言模型
目标=ESM · ProtBert等嵌入特征提取与微调…
预训练蛋白语言模…ESM
14
结构感知模型
目标=利用AlphaFold预测结构…
结构感知模型AlphaFold
15
模型训练与验证策略
目标=交叉验证 · 留一法 · 独立测试集与数据泄漏防范
模型训练验证策略
16
评估指标与误差分析
目标=皮尔逊相关系数 · 均方根误差 · 符号准确率与鲁棒性
评估指标误差分析
17
突变稳定性预测工具实战
目标=Rosetta ddg_mon… · FoldX · I-Mutant等使用与对比
突变稳定性预测工…Rosetta
18
工程化流水线设计
目标=从突变输入到预测输出的自动化模…
工程化流水线设计目标=从突变输入…
19
大规模突变扫描预测
目标=饱和突变文库稳定性预测与并行计…
大规模突变扫描预…目标=饱
20
多突变组合稳定性预测
目标=上位效应 · 加性模型与非加性效应处理
多突变组合稳定性…目标=上位效应
21
预测结果解释与可视化
目标=热图 · 结构映射 · 残基贡献分析与报告生成
预测结果解释可视化
22
主动学习与实验闭环
目标=预测-实验-再训练迭代优化策略
主动学习实验闭环
23
迁移学习与少样本场景
目标=小样本突变数据下的模型适应与领…
迁移学习少样本场景
24
不确定性量化
目标=贝叶斯神经网络 · 集成方法在稳定性预测中的置信度评估
不确定性量化目标=贝叶斯神经…
25
蛋白稳定性工程改造案例
目标=工业酶热稳定性提升的预测驱动设…
蛋白稳定性工程改…目标=工业酶热稳…
26
抗体与治疗性蛋白突变稳定性预测
目标=聚集倾向 · 表达量与稳定性权衡
抗体治疗性蛋白突变稳…
27
模型部署与Web服务
目标=容器化 · API设计 · 云端推理与用户界面
Web模型部署
28
基准测试与竞赛
目标=CAGI · S2648等基准数据集上的模型评测与…
基准测试竞赛
29
前沿进展与局限
目标=最新模型 · 数据瓶颈 · 结构动态与溶剂效应挑战
前沿进展局限
30
课程综合项目
目标=针对真实蛋白靶点完成突变稳定性…
课程综合项目目标=针对真实蛋…