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CRISPR编辑效率检测工程

共计 30 章节
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01
CRISPR编辑效率检测工程导论
目标=课程目标 · 检测工程的定义与范畴 · 编辑效率的核心指标
CRISPR编辑效率检测工程…
02
编辑效率检测的生物学基础
目标=CRISPR-Cas系统类型 · DNA修复途径（NHEJ/HR/MM… · 编辑结果类型（indel
编辑效率检测的生…CRISPR-Cas
03
检测样本的获取与处理
目标=细胞系 · 原代细胞 · 组织样本
检测样本的获取处理
04
靶点设计与检测引物开发
目标=sgRNA设计原则 · 脱靶预测 · 检测引物设计（扩增子长度
靶点设计检测引物开发
05
基于凝胶电泳的编辑效率初筛
目标=T7E1/Surveyor酶切… · RFLP法 · 琼脂糖凝胶定量
基于凝胶电泳的编…T7E1/Surveyo…
06
基于毛细管电泳的 indel 检测
目标=片段分析原理 · 荧光标记引物 · 峰图解析
indel基于毛细管电泳的
07
Sanger测序与编辑效率分析
目标=直接测序 · 克隆测序 · TIDE/ICE算法原理
Sanger测序
08
高通量测序（NGS）在编辑效率检测中的应用
目标=扩增子测序 · 全基因组测序 · 靶向捕获
NGS高通量测序
09
数字PCR（ddPCR）定量编辑效率
目标=微滴生成 · 探针设计 · 绝对定量
PCRddPCR
10
实时定量PCR（qPCR）检测编辑效率
目标=SYBR Green与TaqM… · 相对定量 · ΔΔCt法
PCRqPCR
11
基于报告基因的编辑效率检测
目标=荧光蛋白报告系统 · 酶报告系统 · 流式细胞术分析
基于报告基因的编…目标=荧光蛋白报…
12
蛋白质水平检测编辑效率
目标=Western blot · 免疫荧光 · 流式细胞术
蛋白质水平检测编…Western
13
单细胞水平编辑效率检测
目标=单细胞测序 · 单细胞PCR · 微流控技术
单细胞水平编辑效…目标=单细胞测序
14
编辑效率检测中的对照设计
目标=阳性对照 · 阴性对照 · 空白对照
编辑效率检测对照设计
15
编辑效率检测的标准化与质量控制
目标=标准品制备 · 质控指标 · 批间差
编辑效率检测的标…质量控制
16
脱靶效应检测与编辑效率关联
目标=全基因组脱靶检测方法（GUID… · CIRCLE-seq · DISCOVER-seq）
脱靶效应检测编辑效率关联
17
大片段缺失与结构变异检测
目标=长片段PCR · Southern blot · 光学基因组图谱
大片段缺失结构变异检测
18
同源重组（HDR）效率检测
目标=供体模板设计 · HDR报告系统 · 数字PCR
HDR同源重组
19
碱基编辑效率检测
目标=碱基编辑器类型 · 靶向深度测序 · 编辑窗口分析
碱基编辑效率检测目标=碱基编辑器…
20
先导编辑（Prime Editing）效率检测
目标=pegRNA设计 · 编辑产物分析 · NGS与Sanger验证
PrimeEditing
21
植物CRISPR编辑效率检测
目标=原生质体 · 再生植株 · 叶片组织
CRISPR植物
22
动物模型CRISPR编辑效率检测
目标=胚胎 · 小鼠 · 斑马鱼
CRISPR动物模型
23
临床前与临床样本编辑效率检测
目标=细胞治疗产品 · 基因治疗载体 · 监管要求
临床前临床样本编辑效率…
24
编辑效率检测的数据分析与可视化
目标=数据清洗 · 效率计算算法 · 统计检验
编辑效率检测的数…可视化
25
编辑效率检测的自动化与高通量平台
目标=液体处理工作站 · 微孔板检测 · 自动化数据分析
编辑效率检测的自…高通量平台
26
CRISPR编辑效率检测的常见问题与故障排除
目标=假阳性/假阴性 · 引物二聚体 · 模板污染
CRISPR编辑效率检测的常…
27
编辑效率检测工程实战
目标=从靶点设计到报告输出全流程模拟 · 案例拆解 · 团队协作与项目管理
编辑效率检测工程…目标=从靶点设计…
28
编辑效率检测新方法与技术前沿
目标=新型报告系统 · 单分子检测 · 人工智能辅助分析
编辑效率检测新方…技术前沿
29
编辑效率检测的伦理与法规
目标=基因编辑监管 · 检测数据真实性 · 患者隐私
编辑效率检测的伦…法规
30
课程总结与能力评估
目标=核心知识回顾 · 技能自评 · 综合项目设计
课程总结能力评估