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CRISPR功能基因组筛选工程

共计 30 章节
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01
CRISPR功能基因组筛选工程导论
目标=定义 · 技术演进 · 核心应用场景与工程化思维框架
CRISPR功能基因组筛选工…
02
CRISPR筛选的生物学基础
目标=Cas9 · Cas12 · Cas13等效应蛋白的切割机制
CRISPR筛选的生物学基础
03
sgRNA文库设计原理
目标=靶向效率预测 · 脱靶评分 · 覆盖度与冗余度
sgRNA文库设计原理
04
文库构建与扩增工程
目标=寡核苷酸合成 · 克隆策略 · 电转化与噬菌体包装
文库构建扩增工程
05
慢病毒与逆转录病毒递送系统
目标=滴度测定 · 感染复数控制 · 单拷贝整合验证与安全考量
慢病毒逆转录病毒递送系…
06
非病毒递送与新型载体
目标=脂质纳米颗粒 · AAV · 转座子与CRISPR核糖核蛋白递送策…
非病毒递送新型载体
07
细胞模型选择与工程化
目标=癌细胞系 · 原代细胞 · 类器官
细胞模型选择工程化
08
动物模型中的体内筛选
目标=小鼠肿瘤模型 · PDX · 免疫健全模型与递送途径比较
动物模型体内筛选
09
筛选实验设计基础
目标=生物学重复 · 时间点 · 选择压力
筛选实验设计基础目标=生物学重复
10
阴性选择与阳性选择筛选
目标=药物抗性 · 毒素 · 感染
阴性选择阳性选择筛选
11
基于报告基因的筛选
目标=荧光激活细胞分选 · 表面标记 · 信号通路报告系统与动态范围优化
基于报告基因的筛…目标=荧光激活细…
12
CRISPR干扰与激活筛选
目标=dCas9-KRAB · dCas9-VP64 · SunTag等系统的原理
CRISPR干扰
13
碱基编辑与先导编辑筛选
目标=编辑窗口 · 脱氨酶选择 · 筛选策略与突变功能解析
碱基编辑先导编辑筛选
14
组合筛选与遗传相互作用
目标=双sgRNA文库 · 成对CRISPR · 合成致死与旁路抑制筛选
组合筛选遗传相互作用
15
全基因组筛选的湿实验流程
目标=细胞扩增 · 感染 · 选择
全基因组筛选的湿…目标=细胞扩增
16
测序文库制备与高通量测序
目标=sgRNA扩增 · 索引添加 · 测序深度
测序文库制备高通量测序
17
筛选数据分析流程
目标=原始读段处理 · 归一化 · sgRNA水平统计与基因水平聚合算法
筛选数据分析流程目标=原始读段处…
18
命中基因鉴定与统计方法
目标=MAGeCK · RIGER · CRISPResso等工具
基因鉴定统计方法
19
脱靶效应与假阳性控制
目标=计算预测 · 实验验证 · 对照文库与正交筛选策略
脱靶效应假阳性控制
20
筛选结果的实验验证
目标=单基因敲除 · 过表达 · rescue实验
筛选结果的实验验…目标=单基因敲除
21
功能基因组学整合分析
目标=转录组 · 蛋白质组 · 代谢组与筛选数据的多组学关联
功能基因组学整合…目标=转录组
22
CRISPR筛选在癌症靶点发现中的应用
目标=耐药 · 转移 · 免疫逃逸与肿瘤微环境相互作用
CRISPR筛选
23
CRISPR筛选在免疫治疗中的应用
目标=T细胞功能 · 免疫检查点 · CAR-T优化与体内筛选案例
CRISPR筛选
24
CRISPR筛选在感染与宿主因子研究中的应用
目标=病毒进入 · 复制 · 宿主依赖性因子与抗病毒靶点
CRISPR筛选
25
CRISPR筛选在药物开发中的应用
目标=靶点确证 · 机制研究 · 联合用药与生物标志物发现
CRISPR筛选
26
高通量筛选自动化与微流控
目标=液体处理 · 成像 · 单细胞分选与数据追踪的工程实现
高通量筛选自动化微流控
27
单细胞CRISPR筛选技术
目标=Perturb-seq · CROP-seq · 单细胞多组学与克隆追踪
CRISPR单细胞
28
空间CRISPR筛选与组织原位分析
目标=空间转录组 · 原位测序与微环境依赖筛选
CRISPR空间
29
筛选工程中的伦理、生物安全与法规
目标=基因编辑监管 · 双用途研究 · 数据共享与合规要求
筛选工程伦理
30
课程综合实战
目标=从科学问题到筛选方案设计 · 执行 · 分析
课程综合实战目标=从科学问题…