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测序样本前处理与核酸质控工程

共计 30 章节
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01
课程导入与工程全景
目标=测序样本前处理与核酸质控在NG… · 核心目标 · 关键质量属性与常见失败模式
课程导入工程全景
02
样本类型与实验设计对接
目标=基因组DNA · 总RNA · cfDNA
样本类型实验设计对接
03
样本采集、运输与保存工程
目标=采集管选择 · 抗凝剂影响 · 冷链与常温运输
样本采集运输
04
样本接收与预处理决策
目标=外观检查 · 体积与浓度初筛 · 溶血/脂血/黄疸干扰评估及拒收/补救…
样本接收预处理决策
05
核酸提取化学原理与选择
目标=硅胶膜 · 磁珠 · 液相萃取
核酸提取化学原理选择
06
基因组DNA提取实战
目标=组织 · 血液 · 唾液
DNA基因组
07
RNA提取与稳定化实战
目标=Trizol · 柱式 · 磁珠法操作要点
RNA提取
08
cfDNA与低输入样本前处理
目标=血浆分离 · 游离核酸富集 · 低至皮克级DNA的提取与损失最小化策…
cfDNA低输入样本前处理
09
FFPE样本核酸修复与提取
目标=脱蜡 · 解交联 · 片段化修复
FFPE样本核酸修复
10
单细胞与微量样本前处理
目标=细胞分选 · 微流控捕获 · 裂解条件与微量核酸扩增前的质控节点
单细胞微量样本前处理
11
核酸定量方法学与工程选型
目标=紫外分光 · 荧光染料 · qPCR
核酸定量方法学工程选型
12
核酸纯度与污染物评估
目标=A260/A280 · A260/A230 · 盐离子
核酸纯度污染物评估
13
DNA完整性与片段化分析
目标=凝胶电泳 · 毛细管电泳 · 自动化片段分析及DIN/DF值判读与…
DNA完整性
14
RNA完整性与质量评估
目标=RIN/RQN/RNA Int… · 电泳图解读 · 降解样本的建库风险与补救
RNA完整性
15
qPCR与数字PCR在质控中的应用
目标=绝对定量 · 抑制检测 · 片段大小评估
qPCRPCR
16
文库构建前质控节点
目标=起始量判定 · 片段化/末端修复/接头连接前的核酸质…
文库构建前质控节…目标=起始量判定
17
文库构建过程质控
目标=接头连接效率 · PCR循环数优化 · 文库插入片段分布与副产物去除
文库构建过程质控目标=接头连接效…
18
文库定量与均一化
目标=qPCR · 荧光定量 · Agilent片段分析与poolin…
文库定量均一化
19
测序前样本与文库放行体系
目标=QC指标阈值设定 · 放行/复检/拒收流程 · LIMS记录与电子签核
测序前样本文库放行体系
20
自动化前处理平台工程
目标=磁珠法自动化 · 移液工作站 · 微流控与自动化脚本验证
自动化前处理平台…目标=磁珠法自动…
21
防污染与气溶胶控制工程
目标=单向工作流 · 分区管理 · UNG/dUTP系统
防污染气溶胶控制工程
22
标准品、对照与校准
目标=阳性对照 · 阴性对照 · 内标
标准品对照
23
QC数据统计与过程能力
目标=控制图 · Levey-Jennings图 · CV评估
QC数据统计
24
失败样本根因分析与纠正
目标=降解 · 抑制 · 低浓度
失败样本根因分析纠正
25
特殊样本实战案例
目标=古DNA · 环境DNA · 法医微量样本
特殊样本实战案例DNA
26
高通量场景下的样本管理
目标=96/384孔板布局 · 条形码追踪 · 样本混淆预防与自动化数据对接
高通量场景下的样…目标=96
27
方法验证与性能确认
目标=提取效率 · 重复性 · 灵敏度
方法验证性能确认
28
法规、质控标准与实验室认证
目标=ISO 15189 · CAP · CLIA
法规质控标准
29
成本、通量与周期优化
目标=提取试剂选型 · 自动化投入产出 · 批次合并与排程优化
成本通量
30
综合项目实战
目标=从样本接收到测序前放行的完整工… · 包含QC决策 · 异常处理
综合项目实战目标=从样本接收…