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《NGS测序实验平台建设与运行工程》
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NGS测序实验平台建设与运行工程
共计 30 章节
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01
NGS测序平台建设总论
目标=NGS技术演进 · 平台工程定义 · 建设目标
NGS
测序平台建设总论
02
测序平台需求分析与规模设计
目标=样本类型 · 通量预测 · 读长选择
测序平台需求分析
规模设计
03
实验室空间规划与功能分区
目标=试剂准备区 · 样本处理区 · 文库构建区
实验室空间规划
功能分区
04
洁净环境与污染防控工程
目标=洁净等级 · 压差梯度 · 紫外消杀
洁净环境
污染防控工程
05
NGS核心设备选型与评估
目标=高通量测序仪 · 中低通量测序仪 · 自动化工作站
NGS
核心设备选型
06
建库与测序配套设备配置
目标=超声打断仪 · 磁力架 · 温控模块
建库
测序配套设备配置
07
实验室公用工程与基础设施
目标=UPS · 纯水系统 · 压缩空气
实验室公用工程
基础设施
08
样本接收、登记与全流程追踪
目标=LIMS系统 · 条码管理 · 样本状态监控
样本接收
登记
09
核酸提取与质量评估工程化
目标=自动化提取平台 · 提取效率 · 纯度与完整性指标
核酸提取
质量评估工程化
10
文库构建流程标准化
目标=DNA/RNA文库构建 · 酶切法 · 片段化
文库构建流程标准…
DNA/RNA
11
文库质量控制与定量
目标=Qubit · qPCR · Bioanalyzer
文库质量控制
定量
12
测序仪安装、校准与验收
目标=安装环境要求 · 仪器校准 · 性能验证
测序仪安装
校准
13
测序运行操作与实时监控
目标=上机前检查 · 流动池加载 · 测序试剂装载
测序运行操作
实时监控
14
测序数据质量评估与常见问题
目标=Q30 · 簇密度 · PF%
测序数据质量评估
常见问题
15
测序平台日常维护与预防性维护
目标=清洗流程 · 部件更换周期 · 维护日志
测序平台日常维护
预防性维护
16
平台质量控制体系构建
目标=室内质控 · 室间质评 · 标准品与参考品
平台质量控制体系…
目标=室内质控
17
NGS平台标准操作程序编写
目标=SOP结构 · 版本控制 · 培训记录
NGS
平台标准操作程序…
18
实验室信息管理系统与数据流
目标=LIMS · 样本追踪 · 测序数据存储
实验室信息管理系…
数据流
19
测序数据生物信息分析流程搭建
目标=FASTQ质控 · 比对 · 变异检测
测序数据生物信息…
FASTQ
20
NGS平台性能验证与确认
目标=准确性 · 精密度 · 灵敏度
NGS
平台性能验证
21
平台人员组织与培训体系
目标=岗位职责 · 能力矩阵 · 培训计划
平台人员组织
培训体系
22
试剂耗材供应链与库存管理
目标=供应商审计 · 批次验收 · 库存预警
试剂耗材供应链
库存管理
23
NGS平台成本核算与运营效率
目标=单样本成本 · 设备折旧 · 人力成本
NGS
平台成本核算
24
生物安全与实验室安全工程
目标=BSL分级 · 个人防护 · 废弃物处理
生物安全
实验室安全工程
25
平台合规与认证准备
目标=CAP · CLIA · ISO 15189
平台合规
认证准备
26
NGS临床应用场景与平台适配
目标=肿瘤基因检测 · 遗传病检测 · 无创产前检测
NGS
临床应用场景
27
科研级NGS平台建设案例
目标=多组学平台 · 单细胞测序 · 空间转录组平台建设与运行实践
NGS
科研级
28
平台故障排查与应急管理
目标=常见仪器故障 · 试剂问题 · 数据异常
平台故障排查
应急管理
29
平台升级与新技术引入
目标=测序技术迭代 · 设备更新 · 流程优化
平台升级
新技术引入
30
平台建设与运行综合实战
目标=从需求到验收的全流程项目计划 · 里程碑 · 风险控制与运行评估
平台建设
运行综合实战
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