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SMILES序列长度分布可视化教程

共计 30 章节
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01
SMILES简介
什么是SMILES · 化学结构线性表示法
SMILES简介
02
化学信息学基础
分子结构 · 原子 · 键
化学信息学基础分子结构
03
Python与化学信息学
RDKit · Open Babel等工具
Python化学信息学
04
SMILES字符串解析
如何读取和解析SMILES
SMILES字符串解析
05
序列长度分布概念
为什么要分析SMILES长度分布？应…
序列长度分布概念SMILES
06
数据收集
从公共数据库（PubChem · ChEMBL）获取SMILES数据
数据收集PubChem
07
数据清洗
处理无效SMILES · 标准化
数据清洗SMILES
08
计算SMILES长度
Python中计算字符串长度
SMILES计算
09
描述性统计
均值 · 中位数 · 标准差
描述性统计均值
10
直方图绘制
使用matplotlib绘制频率直方…
直方图绘制matplotlib
11
核密度估计图
使用seaborn绘制密度曲线
核密度估计图seaborn
12
箱线图
展示长度分布的四分位数和异常值
箱线图展示长度分布的四…
13
累积分布函数图
CDF图展示
累积分布函数图CDF
14
多组比较
不同数据集（药物 · 天然产物）长度分布对比
多组比较不同数据集
15
分组柱状图
按分子类别分组显示长度
分组柱状图按分子类别分组显…
16
小提琴图
结合箱线图和密度图
小提琴图结合箱线图
17
交互式可视化
Plotly基础介绍
交互式可视化Plotly
18
交互式直方图与缩放
使用plotly制作交互式长度分布图
交互式直方图缩放
19
仪表板构建
使用Dash或Bokeh构建简单仪表…
仪表板构建Dash
20
统计检验
t检验 · ANOVA比较不同组长度差异
统计检验t检验
21
异常值检测
基于长度分布的异常分子识别
异常值检测基于长度分布的异…
22
长度与分子属性关联
长度与分子量 · LogP等的关系
长度分子属性关联
23
散点图矩阵
多变量可视化
散点图矩阵多变量可视化
24
热力图
长度与子结构片段的关系
热力图长度
25
子结构分析
不同环系 · 官能团对应的长度分布
子结构分析不同环系
26
长度分布与化学反应性
案例研究
长度分布化学反应性
27
报告自动生成
使用python生成PDF报告
报告自动生成python
28
最佳实践
代码组织 · 性能优化 · 重复实验
最佳实践代码组织
29
常见问题与调试
解决常见可视化问题
常见问题调试
30
总结与展望
未来方向 · 深度学习在分子表示中的应用
未来方向深度学习