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生物信息学与 AI 制药工程
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060-化合物生成模型结果图谱解读
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《SMILES实时编辑重生成反馈图谱教程》
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SMILES实时编辑重生成反馈图谱教程
共计 30 章节
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01
SMILES简介
什么是SMILES · 历史与应用场景
SMILES
简介
02
原子表示
元素符号 · 原子编号 · 同位素
原子表示
元素符号
03
键表示
单键 · 双键 · 三键
键表示
单键
04
分支结构
括号的使用 · 分支嵌套
分支结构
括号的使用
05
环结构
数字标识环 · 环编号规则
环结构
数字标识环
06
环闭合法
开环与闭环 · 环的优先顺序
环闭合法
开环
07
离子与电荷
正负电荷表示 · 质子化/去质子化
离子
电荷
08
同位素与手性
@标记 · 手性中心
同位素
手性
09
连接表与规范SMILES
不同表示方法
SMILES
连接表
10
典型分子示例
有机小分子 · 药物分子
典型分子示例
有机小分子
11
SMILES解析原理
解析器的工作流程
SMILES
解析原理
12
图论基础
分子图 · 邻接表 · 深度优先
图论基础
分子图
13
实时编辑
输入框 · 语法高亮 · 自动补全
实时编辑
输入框
14
编辑状态管理
撤销 · 重做 · 历史记录
编辑状态管理
撤销
15
重生成机制
编辑后重新生成SMILES · 保持规范
重生成机制
SMILES
16
图谱生成原理
从SMILES到2D坐标布局
图谱生成原理
SMILES
17
力导向布局算法
能量最小化 · 弹簧模型
力导向布局算法
能量最小化
18
原子坐标计算
环的平滑 · 异构体处理
原子坐标计算
环的平滑
19
渲染引擎
使用Canvas或SVG绘制分子结构
渲染引擎
Canvas
20
交互反馈
鼠标悬停高亮 · 原子选择 · 键信息
交互反馈
鼠标悬停高亮
21
反馈图谱
编辑后实时更新图谱 · 动画过渡
反馈图谱
编辑后实时更新图…
22
错误处理
SMILES语法错误的实时提示与定位
错误处理
SMILES
23
性能优化
虚拟DOM · 增量更新 · 防抖节流
性能优化
DOM
24
国际化支持
Unicode字符 · 中文注释
国际化支持
Unicode
25
测试与调试
单元测试 · 集成测试 · 浏览器工具
测试
调试
26
部署与打包
Webpack · Babel · CDN分发
部署
打包
27
插件系统
扩展功能 · 自定义渲染器
插件系统
扩展功能
28
与化学数据库集成
PubChem · ChemSpider查询
化学数据库集成
PubChem
29
分子指纹与相似度
基于SMILES的指纹计算
分子指纹
相似度
30
未来展望
AI生成SMILES · 多分子编辑
未来展望
AI
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