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交互式SMILES编辑图谱解读指南

共计 30 章节
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01
SMILES简介与基本规则
SMILES简介与基本规则 · 核心概念 · 实践要点
SMILES简介
02
SMILES表示法
原子 · 键 · 分支
SMILES表示法
03
SMILES中的环与芳香性
SMILES中的环与芳香性 · 核心概念 · 实践要点
SMILES芳香性
04
SMILES中的立体化学
SMILES中的立体化学 · 核心概念 · 实践要点
SMILES立体化学
05
SMILES中的同位素与电荷
SMILES中的同位素与电荷 · 核心概念 · 实践要点
SMILES同位素
06
SMILES中的括号与连接
SMILES中的括号与连接 · 核心概念 · 实践要点
SMILES括号
07
SMILES字符串的解析原理
SMILES字符串的解析原理 · 核心概念 · 实践要点
SMILES字符串的解析原理
08
常用SMILES工具与库（RDKit, OpenBabel等）
常用SMILES工具与库（RDKit · 核心概念 · 实践要点
SMILESRDKit
09
RDKit基础
分子对象与SMILES互转
RDKitSMILES
10
交互式编辑环境搭建
Jupyter Notebook +…
交互式编辑环境搭…Jupyter
11
使用ipywidgets创建SMILES输入框
使用ipywidgets创建SMILES… · 核心概念 · 实践要点
ipywidgetsSMILES
12
实时SMILES验证与错误提示
实时SMILES验证与错误提示 · 核心概念 · 实践要点
SMILES实时
13
绘制分子结构图
2D坐标生成
绘制分子结构图2D坐标生成
14
交互式分子编辑
添加/删除原子
交互式分子编辑添加
15
交互式分子编辑
修改键类型
交互式分子编辑修改键类型
16
交互式分子编辑
环的闭合与打开
交互式分子编辑环的闭合
17
图谱解读基础
核磁共振（NMR）简介
图谱解读基础NMR
18
SMILES与NMR谱图关联
SMILES与NMR谱图关联 · 核心概念 · 实践要点
SMILESNMR
19
红外光谱（IR）与SMILES
红外光谱（IR）与SMILES · 核心概念 · 实践要点
IRSMILES
20
质谱（MS）与SMILES
质谱（MS）与SMILES · 核心概念 · 实践要点
MSSMILES
21
图谱数据库查询（PubChem, ChemSpider）
图谱数据库查询（PubChem · 核心概念 · 实践要点
PubChemChemSpider
22
交互式图谱显示
使用plotly/d3.js
交互式图谱显示plotly/d3.js
23
从SMILES预测谱图（机器学习方法概述）
从SMILES预测谱图（机器学习方法概述… · 核心概念 · 实践要点
SMILES预测谱图
24
基于SMILES的子结构搜索
基于SMILES的子结构搜索 · 核心概念 · 实践要点
SMILES基于
25
分子相似性计算与聚类
分子相似性计算与聚类 · 核心概念 · 实践要点
分子相似性计算聚类
26
交互式编辑中的撤销/重做功能
交互式编辑中的撤销/重做功能 · 核心概念 · 实践要点
交互式编辑撤销
27
导出编辑后的SMILES与图谱
导出编辑后的SMILES与图谱 · 核心概念 · 实践要点
SMILES导出编辑后的
28
案例
药物分子优化与谱图验证
案例药物分子优化
29
案例
天然产物结构解析
案例天然产物结构解析
30
课程总结与资源推荐
课程总结与资源推荐 · 核心概念 · 实践要点
课程总结资源推荐