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药物知识图谱学习路径规划

共计 30 章节
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01
药物知识图谱导论
药物知识图谱概念 · 发展历程 · 应用价值与挑战
药物知识图谱导论药物知识图谱概念
02
药物基础知识
药物化学基础 · 药物靶点 · 药物作用机制简介
药物基础知识药物化学基础
03
生物医学数据源概述
公开药物数据库（DrugBank · ChEMBL · PubChem）介绍与使用
生物医学数据源概…DrugBank
04
知识图谱基础理论
图模型 · 三元组 · RDF与RDFS
知识图谱基础理论图模型
05
图数据库入门
Neo4j安装与Cypher查询语言…
图数据库入门Neo4j
06
知识图谱构建流程
数据采集 · 实体识别 · 关系抽取
知识图谱构建流程数据采集
07
命名实体识别（NER）
基于规则与基于深度学习的方法 · 在药物文本中的应用
NER命名实体识别
08
关系抽取
远程监督 · 联合抽取方法 · 药物-靶点关系抽取实例
关系抽取远程监督
09
实体链接与标准化
药物实体的标准化（如ChEBI · ATC编码）与消歧
实体链接标准化
10
知识融合与对齐
跨数据库实体对齐 · 本体对齐技术
知识融合对齐
11
本体构建与工程设计
药物领域本体设计原则 · Protégé工具使用
本体构建工程设计
12
知识图谱存储与索引
图数据库优化 · 大规模知识图谱存储方案
知识图谱存储索引
13
知识图谱查询与SPARQL
SPARQL查询语言 · 联邦查询
SPARQL知识图谱查询
14
图嵌入与表示学习
TransE · RotatE · GCN在药物知识图谱中的应用
图嵌入表示学习
15
知识图谱补全与推理
基于规则推理 · 基于嵌入的推理 · 因果推理
知识图谱补全推理
16
药物-药物相互作用预测
基于知识图谱的DDI预测方法与评估
药物药物相互作用预测
17
药物重定位
利用知识图谱发现药物新适应症
药物重定位利用知识图谱发现…
18
药物不良反应预测
利用KG预测未知ADR
药物不良反应预测KG
19
精准医学与个性化治疗
基于知识图谱的基因-药物-疾病关联分…
精准医学个性化治疗
20
知识图谱问答系统
基于KG的QA系统设计与实现
知识图谱问答系统KG
21
图神经网络在KG中的应用
GCN · GAT · RGCN处理异构图
KG图神经网络
22
动态知识图谱
时间演化知识图谱在药物研发中的应用
动态知识图谱时间演化知识图谱
23
知识图谱的可解释性
注意力机制 · 路径解释方法
知识图谱的可解释…注意力机制
24
大规模知识图谱构建工具
Apache Jena · RDF4J · JanusGraph
大规模知识图谱构…Apache
25
知识图谱质量评估与维护
准确性 · 完整性 · 一致性度量
知识图谱质量评估维护
26
联邦知识图谱与隐私保护
多方安全计算与联邦学习在药物KG中的…
联邦知识图谱隐私保护
27
知识图谱与传统NLP结合
BERT嵌入 · 提示学习在KG任务中
NLP知识图谱
28
案例研究
构建一个药物-靶点-疾病知识图谱
案例研究构建一个药物
29
前沿进展
大语言模型在知识图谱构建与推理中的角…
前沿进展大语言模型
30
课程总结与项目实践
综合项目设计与部署
课程总结项目实践