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生物信息学与 AI 制药工程
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059-药物知识图谱解读
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《药物知识图谱可视化分析与交互图表》
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药物知识图谱可视化分析与交互图表
共计 30 章节
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01
药物图谱概述
什么是药物图谱?Visual Ana…
药物图谱概述
Visual
02
数据基础
药物数据来源(PubChem · DrugBank · ChEMBL)与文件格式(CSV
数据基础
PubChem
03
图数据库入门
Neo4j的安装 · 启动与基本操作
图数据库入门
Neo4j
04
Cypher查询语言
节点 · 关系 · 属性
Cypher
查询语言
05
Python与Neo4j交互
使用py2neo连接 · 创建 · 查询图数据
Python
Neo4j
06
药物-靶点关系建模
实体定义 · 关系类型 · 属性设计
药物
靶点关系建模
07
药物-疾病关系建模
关联规则 · 权值计算 · 图存储
药物
疾病关系建模
08
药物-副作用关系建模
数据抽取 · 关系层次 · 多源融合
药物
副作用关系建模
09
多维数据整合与清洗
去重 · 标准化 · 缺失值处理实战
多维数据整合
清洗
10
图算法基础
最短路径(BFS/DFS) · PageRank · 社区发现(Louvain)
图算法基础
BFS/DFS
11
药物相似性计算
基于图结构(Tanimoto系数) · 基于路径的相似性
药物相似性计算
Tanimoto
12
NetworkX图分析库
构建药物关系图 · 计算网络度量
NetworkX
图分析库
13
D3.js可视化入门
力导向图布局 · 节点与边样式
D3.js
可视化入门
14
交互式可视化
使用Plotly构建可拖拽的药物图谱
交互式可视化
Plotly
15
药物-靶点网络可视化实战
从Neo4j到前端呈现
药物
靶点网络可视化实…
16
药物重定位分析
基于最短路径的候选药物推荐
药物重定位分析
基于最短路径的候…
17
图神经网络入门
PyTorch Geometric安…
图神经网络入门
PyTorch
18
药物知识图谱构建
本体设计 · 实体链接与关系抽取
药物知识图谱构建
本体设计
19
PyTorch Geometric药物图分析
链接预测 · 节点分类
PyTorch
Geometric
20
可视化仪表板
使用Streamlit搭建药物图谱分…
可视化仪表板
Streamlit
21
案例实战
COVID-19药物图谱构建与候选药…
案例实战
COVID-19
22
大规模图谱处理
Spark GraphX分布式图计算…
大规模图谱处理
Spark
23
临床数据与药物图谱融合
电子病历数据导入与关联
临床数据
药物图谱融合
24
药物图谱质量评估
完整性 · 一致性 · 准确性指标
药物图谱质量评估
完整性
25
可视化叙事
用图表讲述药物发现故事(时间轴 · 关系流)
可视化叙事
用图表讲述药物发…
26
多模态药物图谱
整合基因组 · 蛋白质组 · 代谢组数据
多模态药物图谱
整合基因组
27
部署与共享
将药物图谱应用部署到云服务器或Doc…
部署
共享
28
安全与伦理
药物数据隐私保护 · 合规性注意事项
安全
伦理
29
前沿探索
药物图谱与AI驱动的药物发现(Tra… · GNN)
前沿探索
AI
30
总结与未来展望
课程回顾 · 学习路径推荐 · 开源项目介绍
未来展望
课程回顾
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