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生物信息学与 AI 制药工程
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059-药物知识图谱解读
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《药物图谱Docker部署指南》
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药物图谱Docker部署指南
共计 30 章节
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01
药物图谱概述
定义 · 应用场景 · 技术选型
药物图谱概述
定义
02
Docker基础概念
镜像 · 容器 · 仓库
Docker
基础概念
03
Docker安装与配置
Windows/Mac/Linux安… · 加速器配置
Docker
安装
04
Docker命令行入门
pull · run · ps
Docker
命令行入门
05
Dockerfile编写基础
FROM · RUN · COPY
Dockerfile
编写基础
06
Docker镜像构建与优化
多层构建 · 缓存机制 · 减小镜像体积
Docker
镜像构建
07
Docker容器网络模式
bridge · host · none
Docker
容器网络模式
08
Docker数据持久化
卷(Volume) · 绑定挂载(Bind mount)
Docker
数据持久化
09
Docker Compose入门
YAML语法 · 定义服务 · 启动与停止
Docker
Compose
10
Docker Compose进阶
环境变量 · 依赖 · 健康检查
Docker
Compose
11
药物图谱数据模型
节点 · 关系 · 属性(基于Neo4j)
药物图谱数据模型
节点
12
Neo4j图数据库Docker部署
拉取镜像 · 运行容器 · 配置认证
Neo4j
Docker
13
药物图谱数据导入
CSV/JSON导入工具 · Cypher语句批量插入
药物图谱数据导入
CSV/JSON
14
药物图谱API服务(Flask/FastAPI)容器化
编写Dockerfile
API
Flask/FastAP…
15
前端可视化(如D3.js/Vis.js)容器化
Nginx静态文件服务
D3.js/Vis.js
前端可视化
16
多服务编排
使用Docker Compose整合… · 前端 · 数据库
多服务编排
Docker
17
环境管理与配置
使用.env文件 · docker-compose ove…
环境管理
配置
18
日志收集与监控
ELK/EFK集成 · Prometheus + Grafa…
日志收集
监控
19
健康检查与自动重启
HEALTHCHECK · restart策略
健康检查
自动重启
20
安全性实践
非root用户 · 秘密管理 · 网络隔离
安全性实践
root
21
镜像仓库与持续集成
Docker Hub · GitLab Registry · GitHub Actions构建推送
镜像仓库
持续集成
22
持续部署(CD)
使用Ansible/Shell脚本自…
CD
持续部署
23
数据备份与恢复
Neo4j dump/load · 卷快照
数据备份
恢复
24
性能调优
Docker资源限制(CPU/内存) · Neo4j配置优化
性能调优
Docker
25
故障排查
常见错误 · docker logs · docker inspect
故障排查
常见错误
26
负载均衡与反向代理
Nginx+多个服务实例 · Docker Swarm
负载均衡
反向代理
27
容器编排入门
Docker Swarm模式 · 服务部署 · 滚动更新
容器编排入门
Docker
28
Kubernetes基础
Pod · Service · Deployment概念及Minik…
Kubernetes
Pod
29
Helm图表管理
将药物图谱部署为Helm chart
Helm
图表管理
30
课程总结与项目实战
完整部署一个药物图谱应用
课程总结
项目实战
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