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癌症药物知识图谱构建实战

共计 30 章节
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01
知识图谱概述
知识图谱的定义 · 发展历史 · 典型应用（如Google Knowl…
知识图谱概述知识图谱的定义
02
癌症药物领域基础
癌症类型 · 药物分类（化疗药 · 靶向药
癌症药物领域基础癌症类型
03
知识图谱构建技术栈
主要工具（Neo4j · RDF · SPARQL）
知识图谱构建技术…Neo4j
04
数据源收集与整合
公开癌症药物数据源（DrugBank · NCI Thesaurus · PubMed）
数据源收集整合
05
数据预处理
文本清洗 · 格式统一 · 数据规范化（药物名称
数据预处理文本清洗
06
实体识别（NER）基础
基于规则 · 基于字典 · 基于机器学习的NER方法
NER实体识别
07
癌症药物领域NER实践
使用spaCy训练自定义NER模型识… · 癌症 · 基因等实体
NER癌症药物领域
08
关系抽取（RE）基础
基于模板 · 基于监督学习的RE方法（CNN · LSTM
RE关系抽取
09
关系抽取实践
抽取“药物-治疗-癌症 · 药物-靶点-基因”等关系 · 使用预训练模型微调
关系抽取实践抽取“药物
10
知识融合
实体对齐 · 同义合并（如药物别名 · 基因别名）
知识融合实体对齐
11
知识表示学习
TransE · TransR · RotatE等知识嵌入方法
知识表示学习TransE
12
知识存储方案
图数据库（Neo4j）与三元组存储（… · 选择适合的方案
知识存储方案Neo4j
13
使用Neo4j构建知识图谱
图模型设计 · Cypher语言 · 导入数据
Neo4j使用
14
知识图谱查询与检索
Cypher查询示例 · 根据药物查询相关癌症 · 副作用等
知识图谱查询检索
15
知识图谱可视化
使用vis.js · D3.js · Neo4j Browser展示图谱
知识图谱可视化vis.js
16
知识图谱评估
准确率 · 召回率 · F1值
知识图谱评估准确率
17
基于知识图谱的药物推荐
利用图算法（PageRank · Node2Vec）进行药物重定位
基于知识图谱的药…PageRank
18
基于知识图谱的问答系统
问题解析 · 实体链接 · 答案生成
基于知识图谱的问…问题解析
19
癌症药物知识图谱Web应用开发
使用Flask/Django搭建前后…
Web癌症药物知识图谱
20
知识图谱动态更新
增量学习 · 新数据融合 · 版本管理
知识图谱动态更新增量学习
21
大规模知识图谱构建
分布式计算 · Spark GraphX · 数据并行处理
大规模知识图谱构…分布式计算
22
癌症药物知识图谱应用案例1
药物-靶点相互作用预测
癌症药物知识图谱…药物
23
癌症药物知识图谱应用案例2
药物副作用预测与安全性分析
癌症药物知识图谱…药物副作用预测
24
癌症药物知识图谱应用案例3
个性化治疗方案推荐
癌症药物知识图谱…个性化治疗方案推…
25
知识图谱与机器学习融合
图神经网络（GNN）在药物发现中的应…
知识图谱机器学习融合
26
可解释性知识图谱
规则抽取 · 解释推理路径
可解释性知识图谱规则抽取
27
知识图谱质量保障
数据一致性 · 完整性 · 时效性检查
知识图谱质量保障数据一致性
28
实战项目
从零构建一个癌症药物知识图谱（数据集… · 流程实现）
实战项目从零构建一个癌症…
29
实战项目
知识图谱API开发与部署
实战项目API
30
课程总结与未来展望
知识图谱在精准医学中的前景 · 挑战与趋势
课程总结未来展望