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本课程属于：054-单细胞空间整合特征学习任务 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
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空间转录组细胞邻域特征建模教程

共计 30 章节
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01
空间转录组技术发展与应用概览
空间转录组技术发展与应用概览 · 核心概念 · 实践要点
空间转录组技术发…应用概览
02
空间转录组数据获取与质量评估
空间转录组数据获取与质量评估 · 核心概念 · 实践要点
空间转录组数据获…质量评估
03
数据预处理
标准化 · 降维 · 聚类
数据预处理标准化
04
空间坐标系统与组织区域标注
空间坐标系统与组织区域标注 · 核心概念 · 实践要点
空间坐标系统组织区域标注
05
邻域定义
k近邻 · 半径邻域 · 图邻域
邻域定义k近邻
06
空间权重矩阵构建（距离、核函数）
空间权重矩阵构建（距离、核函数） · 核心概念 · 实践要点
空间权重矩阵构建距离
07
基于邻域的基因表达特征提取
基于邻域的基因表达特征提取 · 核心概念 · 实践要点
基于邻域的基因表…重点
08
空间自相关分析
Moran's I · Geary's C
空间自相关分析Moran
09
细胞类型空间分布与共定位分析
细胞类型空间分布与共定位分析 · 核心概念 · 实践要点
细胞类型空间分布共定位分析
10
邻域细胞组成特征向量
邻域细胞组成特征向量 · 核心概念 · 实践要点
邻域细胞组成特征…重点
11
图神经网络基础
GCN · GAT · GraphSAGE
图神经网络基础GCN
12
空间图构建方法与节点特征
空间图构建方法与节点特征 · 核心概念 · 实践要点
空间图构建方法节点特征
13
空间图自编码器与表示学习
空间图自编码器与表示学习 · 核心概念 · 实践要点
空间图自编码器表示学习
14
对比学习在空间邻域特征中的应用
对比学习在空间邻域特征中的应用 · 核心概念 · 实践要点
对比学习空间邻域特征
15
空间域识别（Spatial Domain Identification）方法
空间域识别（Spatial Domain… · 核心概念 · 实践要点
SpatialDomain
16
基于邻域的配体-受体互作分析
基于邻域的配体-受体互作分析 · 核心概念 · 实践要点
基于邻域的配体受体互作分析
17
细胞邻域通讯网络建模
细胞邻域通讯网络建模 · 核心概念 · 实践要点
细胞邻域通讯网络…重点
18
空间转录组与单细胞整合分析中的邻域特征
空间转录组与单细胞整合分析中的邻域特征 · 核心概念 · 实践要点
空间转录组单细胞整合分析
19
马尔可夫随机场与条件随机场在空间建模中应用
马尔可夫随机场与条件随机场在空间建模中应… · 核心概念 · 实践要点
马尔可夫随机场条件随机场
20
点模式分析与空间统计模型
点模式分析与空间统计模型 · 核心概念 · 实践要点
点模式分析空间统计模型
21
空间变异基因检测（SVG）
空间变异基因检测（SVG） · 核心概念 · 实践要点
SVG空间变异基因检测
22
空间轨迹推断与邻域动态
空间轨迹推断与邻域动态 · 核心概念 · 实践要点
空间轨迹推断邻域动态
23
细胞邻域迁移学习与跨平台泛化
细胞邻域迁移学习与跨平台泛化 · 核心概念 · 实践要点
细胞邻域迁移学习跨平台泛化
24
多模态空间数据融合（组学+组织学）
多模态空间数据融合（组学+组织学） · 核心概念 · 实践要点
多模态空间数据融…组学+组织学
25
大规模空间转录组数据的高效邻域查询
大规模空间转录组数据的高效邻域查询 · 核心概念 · 实践要点
大规模空间转录组…重点
26
模型可解释性
注意力机制与邻域贡献
模型可解释性注意力机制
27
可视化工具
空间特征图 · 邻域热图 · 网络图
可视化工具空间特征图
28
基准测试与评估指标（ARI, NMI, Silhouette等）
基准测试与评估指标（ARI · 核心概念 · 实践要点
ARINMI
29
实战项目1
使用SpaGCN进行空间域识别
实战项目1SpaGCN
30
实战项目2
构建自定义细胞邻域特征用于疾病分类
实战项目2构建自定义细胞邻…