VIP20
本课程属于：053-药物知识图谱特征学习任务 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

R语言药物知识图谱特征提取与网络可视化

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
R语言入门
R语言简介 · 安装与配置 · RStudio IDE介绍
R语言入门R语言简介
02
R语言基础
数据类型 · 向量 · 矩阵
R语言基础数据类型
03
数据导入导出
CSV · Excel · 数据库连接与操作
数据导入导出CSV
04
dplyr数据清洗
filter · select · mutate
dplyr数据清洗
05
tidyverse生态
ggplot2 · tidyr · readr
tidyverse生态
06
字符串处理与正则表达式。
字符串处理与正则表达式 · 核心概念 · 实践要点
字符串处理正则表达式
07
药物知识图谱概述
概念 · 应用场景 · 常见公开知识图谱
药物知识图谱概述概念
08
药物数据源
DrugBank · KEGG · STITCH
药物数据源DrugBank
09
图论基础
节点 · 边 · 度
图论基础节点
10
igraph包入门
创建图 · 基本属性 · 邻接矩阵
igraph包入门
11
构建药物-靶点网络
从表格数据到图对象
构建药物靶点网络
12
网络可视化基础
igraph绘图参数 · 布局算法
网络可视化基础igraph
13
ggplot2扩展
ggraph包与图形语法绘图
ggplot2扩展
14
交互式网络
visNetwork包实现动态探索
交互式网络visNetwork
15
网络拓扑特征
度分布 · 聚类系数 · 平均路径长度
网络拓扑特征度分布
16
社区发现
Louvain算法 · Girvan-Newman算法 · 谱聚类
社区发现Louvain
17
药物相似性网络
基于化学结构 · 靶点 · 侧面的相似性计算
药物相似性网络基于化学结构
18
药物-疾病关联分析
通过共享靶点或通路推断
药物疾病关联分析
19
特征提取
网络嵌入方法（node2vec · DeepWalk）在R中的实现
特征提取node2vec
20
图神经网络基础
概念 · 主流模型（GCN · GAT）及R包简介
图神经网络基础概念
21
知识图谱推理
路径排序 · 逻辑规则挖掘
知识图谱推理路径排序
22
药物重定位
基于网络拓扑相似性的候选药物预测
药物重定位基于网络拓扑相似…
23
药物副作用预测
利用网络传播模型
药物副作用预测利用网络传播模型
24
多模态数据融合
整合基因表达 · 蛋白质互作与药物网络
多模态数据融合整合基因表达
25
大规模网络处理
igraph性能优化 · 内存管理
大规模网络处理igraph
26
分布式图计算
R与Spark GraphX接口
分布式图计算Spark
27
模型评估
交叉验证 · AUC-ROC · NLP评价指标
模型评估交叉验证
28
案例
COVID-19药物筛选知识图谱分析
案例COVID-19
29
综合项目
搭建药物-靶点-疾病知识图谱与特征分…
综合项目搭建药物
30
前沿与展望
R在药物知识图谱中的角色与未来方向
前沿R