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生物信息学与 AI 制药工程
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053-药物知识图谱特征学习任务
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《ComplEx模型药物关系预测实战》
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本课程属于:053-药物知识图谱特征学习任务
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ComplEx模型药物关系预测实战
共计 30 章节
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01
药物关系预测概述与ComplEx模型简介
药物关系预测概述与ComplEx模型简介 · 核心概念 · 实践要点
ComplEx
药物关系预测概述
02
知识图谱嵌入基础
TransE与DistMult
知识图谱嵌入基础
TransE
03
ComplEx模型数学原理
复数空间嵌入
ComplEx
模型数学原理
04
数据集准备
DrugBank与BioKG
数据集准备
DrugBank
05
数据预处理
实体 · 关系与三元组提取
数据预处理
实体
06
负采样策略与训练数据构建
负采样策略与训练数据构建 · 核心概念 · 实践要点
负采样策略
训练数据构建
07
搭建开发环境
PyTorch与DGL
搭建开发环境
PyTorch
08
实现ComplEx模型
核心代码剖析
ComplEx
实现
09
损失函数与评分函数详解
损失函数与评分函数详解 · 核心概念 · 实践要点
损失函数
评分函数详解
10
优化器选择与超参数设置
优化器选择与超参数设置 · 核心概念 · 实践要点
优化器选择
超参数设置
11
训练循环与评估指标
MRR · Hits@K
训练循环
评估指标
12
模型评估与聚类分析
模型评估与聚类分析 · 核心概念 · 实践要点
模型评估
聚类分析
13
结果可视化
嵌入向量降维
结果可视化
嵌入向量降维
14
超参数调优
网格搜索与贝叶斯优化
超参数调优
网格搜索
15
正则化与避免过拟合
正则化与避免过拟合 · 核心概念 · 实践要点
正则化
避免过拟合
16
多任务学习
药物-靶点关系联合预测
多任务学习
药物
17
大规模数据训练技巧
梯度累积与混合精度
大规模数据训练技…
梯度累积
18
模型推理与预测API实现
模型推理与预测API实现 · 核心概念 · 实践要点
API
模型推理
19
应用案例
药物-药物相互作用预测
应用案例
药物
20
应用案例
药物-靶标亲和力预测
应用案例
药物
21
对比实验
ComplEx vs 其他模型
对比实验
ComplEx
22
模型解释性与注意力机制
模型解释性与注意力机制 · 核心概念 · 实践要点
模型解释性
注意力机制
23
知识图谱补全与链接预测
知识图谱补全与链接预测 · 核心概念 · 实践要点
知识图谱补全
链接预测
24
模型部署
ONNX与TorchScript导出
模型部署
ONNX
25
Web服务搭建
FastAPI接口
Web
服务搭建
26
批量预测与性能测试
批量预测与性能测试 · 核心概念 · 实践要点
批量预测
性能测试
27
常见问题与调试经验
常见问题与调试经验 · 核心概念 · 实践要点
常见问题
调试经验
28
实战项目一
构建小型药物关系预测系统
实战项目一
构建小型药物关系…
29
实战项目二
利用预训练模型迁移学习
实战项目二
利用预训练模型迁…
30
总结与未来展望
图神经网络与其他方向
未来展望
图神经网络
所属VIP或分类
同VIP:DGL框架药物图神经网络实践
同VIP:PyG与Neo4j药物KG特征提取课程
同VIP:RotatE与GCN在药物KG中的应用资料