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生物信息学与 AI 制药工程
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039-单细胞空间整合批次质控
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《GPU加速Harmony校正实践》
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GPU加速Harmony校正实践
共计 30 章节
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01
课程介绍与GPU基础
GPU的发展历史 · 并行计算优势 · GPU与CPU对比
GPU
课程介绍
02
GPU架构概述
NVIDIA CUDA核心架构 · SM(流多处理器)组成 · 内存层次(全局
GPU
架构概述
03
CUDA编程模型入门
CUDA安装与环境配置 · nvcc编译器 · 第一个CUDA程序(向量加法)
CUDA
编程模型入门
04
CUDA程序结构
kernel定义与启动 · grid · block
CUDA
程序结构
05
CUDA内存管理
cudaMalloc/cudaFre… · cudaMemcpy · 统一内存(Unified Memor…
CUDA
内存管理
06
GPU并行计算模式
SIMT执行模型 · warp与warp调度 · 分支发散(warp divergen…
GPU
并行计算模式
07
GPU性能优化基础
占用率(occupancy)计算 · 内存合并(coalesced acc… · bank conflict避免
GPU
性能优化基础
08
Harmony校正概述
色彩和谐(Color Harmony… · 历史与理论 · 应用场景(图像增强
Harmony
校正概述
09
色彩空间与变换
RGB · HSV · Lab
色彩空间
变换
10
色彩和谐规则
互补色 · 类似色 · 三角色
色彩
谐规则
11
传统CPU实现Harmony校正
串行算法设计 · 像素遍历 · 和谐度量计算
CPU
Harmony
12
GPU加速思路
数据并行性提取 · 任务分解 · kernel设计策略
GPU
加速思路
13
CUDA实现色彩空间转换
RGB→HSV kernel编写 · float4操作 · 内存访问优化
CUDA
实现色彩空间转换
14
CUDA实现和谐规则计算
并行计算各像素和谐度量 · 归约求和 · 全局统计
CUDA
实现
15
CUDA实现像素校正映射
基于和谐规则的校正函数 · 查找表(LUT)加速 · 局部变量与寄存器优化
CUDA
实现像素校正映射
16
共享内存优化加速
tiling技术 · shared memory分配 · 同步
共享内存优化加速
tiling
17
并行归约与统计计算
树形归约 · warp shuffle指令 · 全局统计量(均值
并行归约
统计计算
18
原子操作与同步
atomicAdd/atomicEx… · 锁与临界区 · 全局同步技巧
原子操作
同步
19
多GPU并行策略
多设备枚举 · 数据划分 · peer-to-peer通信
GPU
并行策略
20
CUDA流与并发执行
创建流 · 异步操作 · 事件机制
CUDA
并发执行
21
NVIDIA Nsight调试与性能分析
Nsight Systems时间线 · Nsight Compute内核分析 · 瓶颈定位与优化建议
NVIDIA
Nsight
22
GPU加速图像预处理
图像解码与上传 · 缩放 · 滤波(高斯
GPU
加速图像预处理
23
真实图像处理流水线整合
从磁盘读取→预处理→Harmony校… · 完整CUDA流设计
真实图像处理流水…
Harmony
24
大规模图像数据集处理
批量处理模式 · 动态加载 · 内存池管理
大规模图像数据集…
批量处理模式
25
实时视频Harmony校正
视频帧采集 · GPU加速解码(NVDEC) · 帧间一致性
Harmony
实时视频
26
混合精度与Tensor Core加速
float16 · bfloat16 · Tensor Core简介
Tensor
Core
27
使用CUDA库辅助计算
cuBLAS矩阵运算 · cuFFT频域和谐滤波 · cuRAND随机采样
CUDA
使用
28
OpenCV与GPU互操作
OpenCV GpuMat · CUDA与OpenCV数据交换 · 无缝集成
OpenCV
GPU
29
项目实战
构建GPU加速Harmony校正工具 · 架构设计 · 编码实现
项目实战
GPU
30
课程总结与进阶方向
关键知识点回顾 · 前沿技术(AI驱动和谐校正 · 光线追踪)
课程总结
进阶方向
所属VIP或分类
同VIP:10x-Visium与Slide-seq数据整合实践
同VIP:CellChat分析批次效应消除方法
同VIP:GPU加速单细胞批次校正实战