VIP20
本课程属于：030-空间转录组批次质控 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

肿瘤多组学批次效应校正与质量验证

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
批次效应概述与来源
批次效应概述与来源 · 核心概念 · 实践要点
批次效应概述来源
02
单细胞RNA-seq数据预处理流程
单细胞RNA-seq数据预处理流程 · 核心概念 · 实践要点
RNA-seq单细胞
03
批次效应检测方法（PCA、UMAP可视化）
批次效应检测方法（PCA · 核心概念 · 实践要点
PCAUMAP
04
数据标准化与质量控制
数据标准化与质量控制 · 核心概念 · 实践要点
数据标准化质量控制
05
常用批次效应校正算法概述
常用批次效应校正算法概述 · 核心概念 · 实践要点
常用批次效应校正…重点
06
ComBat算法原理与实战
ComBat算法原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
ComBat算法原理
07
Harmony算法原理与实战
Harmony算法原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
Harmony算法原理
08
Scanorama算法原理与实战
Scanorama算法原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
Scanorama算法原理
09
CCA（Seurat）方法原理与实战
CCA（Seurat）方法原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
CCASeurat
10
MNN（MNN Correct）方法原理与实战
MNN（MNN Correct）方法原理… · 核心概念 · 实践要点
MNNCorrect
11
fastMNN与FurtherMNN实战
fastMNN与FurtherMNN实战 · 核心概念 · 实践要点
fastMNNFurtherMNN
12
BBKNN算法实战
BBKNN算法实战 · 核心概念 · 实践要点
BBKNN算法实战
13
scVI深度学习模型原理与实战
scVI深度学习模型原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
scVI深度学习模型原理
14
scANVI模型原理与实战
scANVI模型原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
scANVI模型原理
15
LIGER方法原理与实战
LIGER方法原理与实战 · 核心概念 · 实践要点
LIGER方法原理
16
数据集合并与全局锚点选择
数据集合并与全局锚点选择 · 核心概念 · 实践要点
数据集合并全局锚点选择
17
校正效果评估指标（ARI、NMI、Kbet等）
校正效果评估指标（ARI · 核心概念 · 实践要点
ARINMI
18
校正效果可视化（UMAP、热图、密度图）
校正效果可视化（UMAP、热图、密度图） · 核心概念 · 实践要点
UMAP校正效果可视化
19
批次效应消除在细胞注释中的应用
批次效应消除在细胞注释中的应用 · 核心概念 · 实践要点
批次效应消除细胞注释
20
批次效应消除在差异表达分析中的影响
批次效应消除在差异表达分析中的影响 · 核心概念 · 实践要点
批次效应消除差异表达分析
21
大规模数据集的批次处理优化策略
大规模数据集的批次处理优化策略 · 核心概念 · 实践要点
大规模数据集的批…重点
22
多批次数据的平衡与整合技巧
多批次数据的平衡与整合技巧 · 核心概念 · 实践要点
多批次数据的平衡整合技巧
23
非单细胞数据（bulk RNA-seq）的批次处理
非单细胞数据（bulk RNA-seq）… · 核心概念 · 实践要点
bulkRNA-seq
24
基于参考数据集的批次校正方法
基于参考数据集的批次校正方法 · 核心概念 · 实践要点
基于参考数据集的…重点
25
迁移学习与批次效应消除的融合
迁移学习与批次效应消除的融合 · 核心概念 · 实践要点
迁移学习批次效应消除的融…
26
实战
从数据加载到校正全流程（Python…
Python从数据加载到校正…
27
实战
利用scanpy与pytorch实现…
scanpypytorch
28
实战
校正结果解读与报告自动生成
校正结果解读报告自动生成
29
常见问题与调试技巧汇总
常见问题与调试技巧汇总 · 核心概念 · 实践要点
常见问题调试技巧汇总
30
总结与最佳实践建议
总结与最佳实践建议 · 核心概念 · 实践要点
最佳实践建议总结与最佳实践建…