VIP20
本课程属于：016-Cromwell WDL云端工作流 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

Cromwell WDL工作流云端执行与资源管理

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
WDL初识
什么是WDL · Cromwell工作流引擎 · WDL在生物信息与云原生中的角色
WDL初识
02
环境搭建
安装Cromwell · Java环境配置 · 本地运行第一个WDL工作流
环境搭建Cromwell
03
WDL基础语法
文件结构 · 版本声明 · workflow与task块
WDL基础语法
04
数据类型入门
Int · Float · Boolean
数据类型入门Int
05
变量与表达式
声明变量 · 赋值 · 算术运算符
变量表达式
06
输入与输出
workflow输入声明 · task输出声明 · 默认值
输入输出
07
运行时配置
runtime块 · docker镜像 · 内存
运行时配置runtime
08
命令编写
command块 · shell脚本嵌入 · 参数引用
命令编写command
09
文件操作
读取文件 · 输出文件 · 路径拼接
文件操作读取文件
10
数组与Map
Array类型 · Map类型 · 索引访问
Map数组
11
条件分支
if-else语句 · 条件表达式 · 多分支场景实践
条件分支if-else
12
循环与Scatter
Scatter语句 · 并行处理 · 元素映射
Scatter循环
13
函数与元数据
built-in函数 · stdout · stderr
函数元数据
14
类型转换与断言
类型检查 · 强制转换 · assert语句
类型转换断言
15
结构化类型
Object · Struct定义 · 字段访问
结构化类型Object
16
调用子工作流
Call嵌套 · 子工作流输入输出传递 · 模块化设计
调用子工作流Call
17
Cromwell配置详解
cromwell.conf基础 · 配置文件位置 · 核心参数
Cromwell配置详解
18
数据库配置
H2 · MySQL · PostgreSQL
数据库配置H2
19
本地后端实战
LocalBackend · 文件系统 · 并发控制
本地后端实战LocalBackend
20
HPC集群后端
HTCondor · SLURM · PBS
HPC集群后端
21
云后端-AWS
AWS Batch · S3存储 · IAM权限
AWS云后端
22
云后端-GCP
Google Cloud Life… · GCS · Service Account
GCP云后端
23
云后端-Azure
Azure Batch · Blob存储 · Managed Identity
Azure云后端
24
Docker集成
Docker镜像拉取 · 自定义镜像 · 多平台支持
Docker集成
25
云存储最佳实践
GCS/S3路径规范 · 大文件分片 · 增量同步
云存储最佳实践GCS/S3
26
监控与调试
Cromwell日志分析 · workflow状态查询 · 失败重试
监控调试
27
WDL测试与验证
womtool语法检查 · 单元测试 · 测试工作流
WDL测试
28
性能优化
任务并行度 · 资源预测 · 缓存复用
性能优化任务并行度
29
安全与权限
最小权限原则 · 密钥管理 · VPC网络
安全权限
30
生产级部署
高可用架构 · CI/CD集成 · 版本管理
生产级部署高可用架构