VIP20
本课程属于：016-Cromwell WDL云端工作流 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

Cromwell并行任务调度与资源容量优化

共计 30 章节
点击此处阅读海量试读课程：100+行业、1000+细分领域
01
Cromwell 简介
工作流引擎背景 · Cromwell 核心概念 · 适用场景与选型分析
Cromwell简介
02
安装与部署
单机模式安装 · Docker 部署 · 集群部署（HTCondor/SLUR…
安装部署
03
第一个工作流
WDL 语法入门 · 编写简单 task · 运行与监控
第一个工作流WDL
04
理解并行度
并行度含义 · Cromwell 并行模型 · 任务并发与数据并发
理解并行度并行度含义
05
配置并行度
cromwell.conf 中 pa… · 全局 vs 任务级别覆盖
配置并行度cromwell.con…
06
资源调优基础
CPU · 内存 · 磁盘定义
资源调优基础CPU
07
容器资源管理
Docker 容器内资源限制 · --memory 与 --cpus…
容器资源管理Docker
08
HPC 后端调优
HTCondor/SLURM 后端的… · 队列调度策略影响
HPC后端调优
09
AWS Batch 后端调优
计算环境配置 · 任务队列 · 资源池与并发上限
AWSBatch
10
Google Cloud Life Sciences 后端调优
虚拟机类型 · 预抢占实例 · 并行配额
GoogleCloud
11
本地后端调优
本地执行器线程池 · I/O 竞争 · 存储瓶颈
本地后端调优本地执行器线程池
12
内存管理技巧
任务内存超售 · OOM 处理 · retry 策略
内存管理技巧任务内存超售
13
CPU 密集任务调优
CPU 超线程 · 绑定核心 · 任务粒度拆分
CPU密集任务调优
14
I/O 密集任务调优
并行读写优化 · 网络延迟 · 临时存储选择
I/O密集任务调优
15
数据本地化策略
数据分片 · CaS 缓存 · 桶与文件系统挂载
数据本地化策略数据分片
16
工作流拆分与合并
scatter 并行 · 子工作流复用 · 任务依赖图精简
工作流拆分合并
17
任务重试与错误处理
retry 次数 · backoff 策略 · 自定义错误码
任务重试错误处理
18
运行时动态资源请求
调用运行时参数 · WDL runtime 块配置
运行时动态资源请…调用运行时参数
19
配置文件优化
cromwell.conf 最佳实践 · 模板示例 · 环境变量注入
配置文件优化cromwell.con…
20
监控与日志
Cromwell 日志解读 · 任务 stdout/stderr · CloudWatch/Stackdr…
监控日志
21
性能指标分析
CPU 利用率 · 内存占满比例 · I/O 等待
性能指标分析CPU
22
常见瓶颈排查
任务排队时间过长 · 资源争抢 · 线程死锁
常见瓶颈排查任务排队时间过长
23
成本优化
Spot 实例使用 · 预留实例 · 存储分层（SSD vs HDD）
成本优化Spot
24
大型工作流实战
1000+ 任务工作流的调度 · 资源规划 · 运行时长压榨
大型工作流实战1000+
25
多租户隔离
资源池划分 · 优先级队列 · 用户配额管理
多租户隔离资源池划分
26
版本兼容与升级
Cromwell 版本变迁 · 配置文件迁移 · WDL 兼容性
版本兼容升级
27
自动化调优工具
推荐超参数搜索 · 自动扩缩容脚本 · 基准测试框架
自动化调优工具推荐超参数搜索
28
与 Nextflow / Snakemake 对比
各自优势 · 迁移路径 · 混合使用场景
NextflowSnakemake
29
安全与权限
IAM 角色 · 密钥管理 · 网络策略对资源调优的影响
安全权限
30
未来趋势与总结
Cromwell 路线图 · 容器化 on K8s · Serverless 方向
未来趋势Cromwell