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本课程属于：004-AutoDock分子对接筛选 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
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AutoDock分子对接完整流程与筛选案例

共计 30 章节
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01
分子对接概述与AutoDock简介
分子对接概述与AutoDock简介 · 核心概念 · 实践要点
AutoDock分子对接概述
02
分子对接原理
锁钥模型与诱导契合
分子对接原理锁钥模型
03
AutoDock软件安装与环境配置
AutoDock软件安装与环境配置 · 核心概念 · 实践要点
AutoDock软件安装
04
受体蛋白质的准备（加氢、去水、调整残基）
受体蛋白质的准备（加氢、去水、调整残基） · 核心概念 · 实践要点
受体蛋白质的准备加氢
05
配体小分子的准备（结构优化、电荷计算）
配体小分子的准备（结构优化、电荷计算） · 核心概念 · 实践要点
配体小分子的准备结构优化
06
AutoDock Tools界面介绍与基本操作
AutoDock Tools界面介绍与基… · 核心概念 · 实践要点
AutoDockTools
07
格点能量计算（AutoGrid）
格点能量计算（AutoGrid） · 核心概念 · 实践要点
AutoGrid格点能量计算
08
对接参数设置（遗传算法参数等）
对接参数设置（遗传算法参数等） · 核心概念 · 实践要点
对接参数设置遗传算法参数等
09
运行AutoDock对接
运行AutoDock对接 · 核心概念 · 实践要点
AutoDock运行
10
结果文件解析（dlg文件等）
结果文件解析（dlg文件等） · 核心概念 · 实践要点
dlg结果文件解析
11
对接结果评价与打分函数
对接结果评价与打分函数 · 核心概念 · 实践要点
对接结果评价打分函数
12
聚类分析（AutoDock聚类结果）
聚类分析（AutoDock聚类结果） · 核心概念 · 实践要点
AutoDock聚类分析
13
可视化结合模式（PyMOL等）
可视化结合模式（PyMOL等） · 核心概念 · 实践要点
PyMOL可视化结合模式
14
柔性对接（柔性残基设定）
柔性对接（柔性残基设定） · 核心概念 · 实践要点
柔性对接柔性残基设定
15
对接参数优化（盒子大小、步长等）
对接参数优化（盒子大小、步长等） · 核心概念 · 实践要点
对接参数优化盒子大小
16
虚拟筛选与批量对接
虚拟筛选与批量对接 · 核心概念 · 实践要点
虚拟筛选批量对接
17
脚本化批量对接（bash/python）
脚本化批量对接（bash/python） · 核心概念 · 实践要点
bash/python脚本化批量对接
18
基于AutoDock Vina的对接（Vina与AutoDock对比）
基于AutoDock Vina的对接（V… · 核心概念 · 实践要点
AutoDockVina
19
ADT进阶
自定义评分函数
ADT进阶
20
分子动力学模拟与对接结合
分子动力学模拟与对接结合 · 核心概念 · 实践要点
分子动力学模拟对接结合
21
蛋白-蛋白对接简介
蛋白-蛋白对接简介 · 核心概念 · 实践要点
蛋白蛋白对接简介
22
水分子在对接中的作用
水分子在对接中的作用 · 核心概念 · 实践要点
水分子对接
23
对接结果的统计分析
对接结果的统计分析 · 核心概念 · 实践要点
对接结果的统计分…重点
24
结合自由能计算（MM-PBSA简介）
结合自由能计算（MM-PBSA简介） · 核心概念 · 实践要点
MM-PBSA结合自由能计算
25
案例1
药物分子与靶点对接实战
案例1药物分子
26
案例2
天然产物虚拟筛选
案例2天然产物虚拟筛选
27
案例3
突变体对接分析
案例3突变体对接分析
28
案例4
酶催化机理的对接研究
案例4酶催化机理的对接…
29
常见问题排查与调试技巧
常见问题排查与调试技巧 · 核心概念 · 实践要点
常见问题排查调试技巧
30
课程总结与未来展望
课程总结与未来展望 · 核心概念 · 实践要点
课程总结未来展望