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t-SNE与UMAP降维可视化教程

共计 30 章节
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01
降维可视化概述
降维的概念 · 常见降维方法 · 可视化在数据分析中的作用
降维可视化概述降维的概念
02
t-SNE基本原理
t-SNE的核心思想 · 概率分布与KL散度
t-SNE基本原理
03
t-SNE数学推导
高维空间高斯分布 · 低维空间t分布 · 梯度计算
t-SNE数学推导
04
t-SNE中的困惑度
困惑度的定义 · 对结果的影响 · 如何选择
t-SNE困惑度
05
t-SNE中的学习率与迭代次数
学习率的作用 · 迭代收敛 · 早停策略
t-SNE学习率
06
t-SNE的实现（scikit-learn）
使用sklearn.manifold… · 代码示例
t-SNEscikit-learn
07
t-SNE的参数调优
参数组合影响 · 网格搜索 · 可视化调优
t-SNE的参数调优
08
t-SNE的实际案例（MNIST）
手写数字数据降维 · 聚类可视化
t-SNEMNIST
09
t-SNE的局限性
局部结构保持 · 全局结构失真 · 速度慢
t-SNE的局限性
10
t-SNE与PCA对比
线性 vs 非线性 · 全局 vs 局部 · 计算复杂度
t-SNEPCA
11
UMAP基本原理
UMAP框架 · 图论与拓扑 · 模糊集合
UMAP基本原理
12
UMAP数学基础
黎曼几何 · 模糊集合 · 交叉熵损失
UMAP数学基础
13
UMAP中的邻居数和最小距离
n_neighbors和min_di… · 选择建议
UMAP邻居数
14
UMAP的实现（umap-learn）
安装 · 基本用法 · 参数设置
UMAPumap-learn
15
UMAP的参数调优
n_components · metric · 学习率等调优
UMAP的参数调优
16
UMAP的实际案例（单细胞数据）
使用scRNA-seq数据降维可视化
UMAP的实际案例
17
UMAP的局限性
超参数敏感 · 可重复性问题 · 对异常值敏感
UMAP的局限性
18
UMAP与t-SNE的对比
速度 · 保真度 · 全局结构
UMAPt-SNE
19
UMAP与t-SNE速度与内存对比
时间复杂度 · 大数据场景表现
UMAPt-SNE
20
高维数据预处理对降维的影响
标准化 · PCA降维后效果 · 噪声影响
高维数据预处理对…标准化
21
使用t-SNE进行图像数据可视化
图像特征提取 · embedding可视化
t-SNE使用
22
使用UMAP进行文本数据可视化
词嵌入 · 文档降维 · 主题分布
UMAP使用
23
UMAP与t-SNE在生物信息学中的应用
基因表达 · 蛋白质组学
UMAPt-SNE
24
降维结果的可解释性评估
聚类指标 · 邻居保持率 · 信任性
降维结果的可解释…聚类指标
25
结合聚类进行降维后的分析
KMeans · DBSCAN · 层次聚类
结合聚类进行降维…KMeans
26
使用增量t-SNE处理大数据
Parametric t-SNE · mini-batch方法
t-SNE使用增量
27
UMAP的增量学习和嵌入扩展
transform方法 · 新数据映射
UMAP的增量学习
28
自定义t-SNE与UMAP的相似度度量
distance metric · 核函数
t-SNEUMAP
29
可视化交互式工具介绍
TensorBoard Embedd… · Plotly
可视化交互式工具…TensorBoard
30
总结与项目实战建议
最佳实践 · 常见问题 · 资源推荐
项目实战建议最佳实践