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药物研发多模态模型评估工程

共计 30 章节
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01
药物研发多模态模型评估工程导论
目标=课程定位 · 核心挑战 · 评估工程与模型开发的关系
药物研发多模态模…目标=课程定位
02
多模态药物研发数据模态与任务映射
目标=化学结构 · 蛋白质序列 · 文本专利
多模态药物研发数…任务映射
03
评估指标体系总览
目标=分类 · 回归 · 排序
评估指标体系总览目标=分类
04
多模态融合架构对评估的影响
目标=早期融合 · 晚期融合 · 交叉注意力
多模态融合架构对…目标=早期融合
05
数据划分工程
目标=随机划分 · 骨架划分 · 时间划分
数据划分工程目标=随机划分
06
数据泄漏识别与防控
目标=多模态数据中的泄漏路径（重复分… · 同源蛋白 · 患者重叠
数据泄漏识别防控
07
基准数据集构建与选择
目标=从BindingDB · PubChem · ChEMBL
基准数据集构建选择
08
评估中的标签噪声与多源冲突
目标=多模态标签不一致 · 实验条件差异 · 活性阈值争议的处理与鲁棒评估策略
评估标签噪声
09
不确定性量化与校准评估
目标=分类校准 · 回归预测区间 · 深度集成
不确定性量化校准评估
10
多模态模型鲁棒性评估
目标=模态缺失 · 模态噪声 · 分布偏移
多模态模型鲁棒性…目标=模态缺失
11
泛化能力评估
目标=跨靶点 · 跨骨架 · 跨物种
泛化能力评估目标=跨靶点
12
可解释性与归因评估
目标=多模态归因方法（注意力 · 梯度 · SHAP
可解释性归因评估
13
生成式多模态模型评估
目标=分子生成 · 文本到分子 · 图像到分子任务的多样性
生成式多模态模型…目标=分子生成
14
检索与匹配任务评估
目标=跨模态检索（文本-分子 · 图像-分子 · 蛋白-分子）的Recall@k
检索匹配任务评估
15
多任务与多标签评估
目标=任务相关性 · 标签不平衡 · 部分标注下的评估指标聚合与分层报告方…
多任务多标签评估
16
评估中的统计显著性
目标=置信区间 · Bootstrap · 交叉验证
评估统计显著性
17
模型比较与排行榜工程
目标=公平比较协议 · 超参数预算控制 · 随机种子敏感性
模型比较排行榜工程
18
评估流水线自动化
目标=从数据加载 · 模态对齐 · 模型推理到指标计算的可复现流水线设计…
评估流水线自动化目标=从数据加载
19
评估结果的可视化与报告
目标=多模态性能雷达图 · 误差分布 · 混淆矩阵
评估结果的可视化报告
20
药物研发决策中的评估阈值
目标=命中率 · 富集因子 · 成本敏感评估
药物研发决策评估阈值
21
ADMET多模态评估实战
目标=吸收 · 分布 · 代谢
ADMET多模态评估实战
22
靶点-分子相互作用多模态评估
目标=对接 · 亲和力预测 · 结合位点识别中的多模态评估与实验验证…
靶点分子相互作用多模…
23
临床前与临床多模态评估
目标=影像 · 组学 · 文本电子病历融合模型在疗效与安全性预…
临床前临床多模态评估
24
分布外与新颖化学空间评估
目标=OOD检测 · 新颖骨架 · 罕见靶点
分布外新颖化学空间评估
25
多模态大模型评估
目标=预训练-微调范式 · 提示工程 · 零样本/少样本评估
多模态大模型评估目标=预训练
26
评估中的伦理、隐私与合规
目标=患者数据去标识化 · 模型偏见审计 · 公平性指标
评估伦理
27
评估驱动的模型迭代
目标=错误分析 · 失败模式分类 · 主动学习
评估驱动的模型迭…目标=错误分析
28
跨机构评估与联邦学习
目标=多中心数据下的分布式评估 · 隐私保护指标聚合 · 异构模态对齐评估
跨机构评估联邦学习
29
评估工程工具链
目标=MLflow · Weights & Biases · DVC
评估工程工具链MLflow
30
综合项目
目标=针对一个多模态药物研发任务（如… · 完成数据划分 · 基线建立
综合项目目标=针对一个多…