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分子骨架跃迁设计工程

共计 30 章节
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01
分子骨架跃迁设计工程导论
目标=定义 · 目标 · 在药物发现与材料设计中的价值
分子骨架跃迁设计…目标=定义
02
骨架跃迁的化学空间与相似性度量
目标=分子指纹 · 骨架树 · 形状与静电相似性
骨架跃迁的化学空…相似性度量
03
骨架跃迁策略分类与选择准则
目标=环替换 · 环开闭 · 骨架重排
骨架跃迁策略分类选择准则
04
基于片段的骨架跃迁设计
目标=片段库构建 · 片段连接与生长 · 从片段命中到跃迁候选的转化路径
基于片段的骨架跃…目标=片段库构建
05
环系跃迁实战
目标=苯环到杂环 · 饱和环到桥环 · 螺环与并环的替换规则与案例解析
环系跃迁实战目标=苯环到杂环
06
骨架跃迁中的药效团约束
目标=药效团建模 · 约束性跃迁设计 · 保持关键相互作用的空间与电子特征
骨架跃迁药效团约束
07
计算工具与平台实操
目标=常用骨架跃迁软件 · 数据库检索 · 自动化候选生成与结果可视化
计算工具平台实操
08
基于配体的骨架跃迁
目标=形状匹配 · 静电匹配 · 药效团匹配
基于配体的骨架跃…目标=形状匹配
09
基于结构的骨架跃迁
目标=蛋白口袋分析 · 热点残基识别 · 对接与分子动力学在跃迁验证中的应用
基于结构的骨架跃…目标=蛋白口袋分…
10
AI驱动的骨架跃迁生成
目标=生成模型 · 强化学习 · 图神经网络
AI驱动的骨架跃迁生…
11
骨架跃迁中的合成可行性评估
目标=逆合成分析 · 反应路线设计 · 商业可得性检查与成本估算
骨架跃迁合成可行性评估
12
骨架跃迁候选的ADMET性质预测
目标=吸收 · 分布 · 代谢
ADMET骨架跃迁候选的
13
骨架跃迁与专利突破
目标=专利空间分析 · 马库什结构规避 · 新颖性检索与自由实施评估
骨架跃迁专利突破
14
骨架跃迁在激酶抑制剂设计中的工程案例
目标=从已知抑制剂到新型骨架的完整设…
骨架跃迁激酶抑制剂设计
15
骨架跃迁在GPCR配体设计中的工程案例
目标=偏向性激动剂 · 变构调节剂的骨架替换策略
GPCR骨架跃迁
16
骨架跃迁在蛋白酶抑制剂设计中的工程案例
目标=从肽类到拟肽 · 非肽骨架的跃迁路径
骨架跃迁蛋白酶抑制剂设计
17
骨架跃迁在蛋白-蛋白相互作用抑制剂设计中的工程案例
目标=从α-螺旋模拟到小分子骨架跃迁
骨架跃迁蛋白
18
骨架跃迁在抗菌与抗病毒药物设计中的工程案例
目标=耐药突变下的骨架创新与多靶点策…
骨架跃迁抗菌
19
骨架跃迁在天然产物衍生化中的应用
目标=复杂骨架简化 · 仿生合成与多样性导向合成
骨架跃迁天然产物衍生化
20
骨架跃迁在材料分子设计中的拓展
目标=有机光电材料 · 共轭骨架替换与性能调控
骨架跃迁材料分子设计
21
骨架跃迁实验验证流程
目标=化合物合成 · 纯化 · 结构表征
骨架跃迁实验验证…目标=化合物合成
22
骨架跃迁的迭代优化循环
目标=设计-合成-测试-分析闭环 · 失败案例分析 · 决策节点管理
骨架跃迁的迭代优…目标=设计
23
多目标骨架跃迁优化
目标=活性 · 选择性 · 成药性
多目标骨架跃迁优…目标=活性
24
骨架跃迁中的化学信息学数据管理
目标=数据库设计 · 数据清洗 · 版本控制与可重复性保障
骨架跃迁化学信息学数据管…
25
骨架跃迁项目实战一
目标=给定靶点与已知配体 · 完成从分析到候选骨架生成的完整任务
骨架跃迁项目实战…目标=给定靶点
26
骨架跃迁项目实战二
目标=对生成的候选骨架进行合成路线设…
骨架跃迁项目实战…目标=对生成的候…
27
骨架跃迁项目实战三
目标=对优选候选进行ADMET预测 · 专利检索与综合评分
骨架跃迁项目实战…ADMET
28
骨架跃迁项目实战四
目标=设计实验验证方案 · 包括活性测定 · 选择性评估与初步毒性测试
骨架跃迁项目实战…目标=设计实验验…
29
骨架跃迁项目实战五
目标=基于实验反馈进行骨架再设计 · 完成至少一轮迭代优化
骨架跃迁项目实战…目标=基于实验反…
30
骨架跃迁设计工程总结与前沿展望
目标=方法学局限 · 自动化与智能化趋势 · 跨学科融合方向
骨架跃迁设计工程…前沿展望