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030-生成式与多模态药物设计工程
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《多目标药物分子优化工程》
VIP12
本课程属于:030-生成式与多模态药物设计工程
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多目标药物分子优化工程
共计 30 章节
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01
课程导入与问题定义
目标=多目标药物分子优化的工程内涵 · 典型目标(活性 · 选择性
课程导入
问题定义
02
分子表示与特征工程
目标=SMILES · 分子图 · 指纹
分子表示
特征工程
03
多目标优化数学基础
目标=帕累托最优 · 支配关系 · 超体积
多目标优化数学基…
目标=帕累托最优
04
药物分子多目标评价体系
目标=活性预测 · 毒性预测 · 药代性质
药物分子多目标评…
目标=活性预测
05
数据获取与清洗工程
目标=ChEMBL · PubChem · ZINC等数据源整合
数据获取
清洗工程
06
分子生成模型基础
目标=VAE · GAN · RNN
分子生成模型基础
VAE
07
多目标分子生成策略
目标=条件生成 · 多目标强化学习 · 多目标遗传算法
多目标分子生成策…
目标=条件生成
08
基于遗传算法的多目标分子优化
目标=分子编码 · 交叉变异算子 · 适应度函数设计
基于遗传算法的多…
目标=分子编码
09
基于深度生成模型的多目标优化
目标=多目标VAE · 多目标GAN · 扩散模型与强化学习结合
基于深度生成模型…
VAE
10
基于贝叶斯优化的多目标分子优化
目标=高斯过程代理模型 · 采集函数(EHVI · ParEGO)
基于贝叶斯优化的…
目标=高斯过程代…
11
多目标强化学习在分子优化中的应用
目标=状态与动作空间设计 · 奖励塑形 · 多目标策略梯度与帕累托Q学习
多目标强化学习
分子优化
12
分子对接与多目标优化
目标=对接打分作为目标之一 · 结合亲和力 · 选择性
分子对接
多目标优化
13
ADMET多目标优化实战
目标=吸收 · 分布 · 代谢
ADMET
多目标优化实战
14
合成可及性与多目标优化
目标=逆合成规划 · 合成难度评分 · 反应可行性约束
合成可
多目标优化
15
多目标分子优化中的约束处理
目标=硬约束与软约束 · 惩罚函数 · 可行性规则
多目标分子优化
约束处理
16
帕累托前沿分析与可视化
目标=前沿逼近 · 多样性保持 · 超体积指标
帕累托前沿分析
可视化
17
多目标优化中的偏好融入
目标=先验偏好 · 后验偏好 · 交互式偏好
多目标优化
偏好融入
18
多目标分子优化的鲁棒性与不确定性
目标=预测模型不确定性量化 · 噪声目标处理 · 鲁棒帕累托优化
多目标分子优化的…
不确定性
19
多目标分子优化中的迁移学习与元学习
目标=跨靶点 · 跨任务知识迁移 · 少样本条件下的多目标优化
多目标分子优化
迁移学习
20
多目标分子优化中的多保真度方法
目标=低成本近似与高成本精确评估结合 · 多保真度贝叶斯优化与进化算法
多目标分子优化
多保真度方法
21
多目标分子优化工程流水线设计
目标=数据管理 · 模型训练 · 优化循环
多目标分子优化工…
目标=数据管理
22
多目标分子优化实验设计与湿实验验证
目标=计算候选到实验验证的闭环 · 实验批次设计 · 反馈整合与迭代优化
多目标分子优化实…
湿实验验证
23
案例研究一
目标=多靶点激酶抑制剂的多目标优化 · 选择性 · ADMET与合成可及性的联合优化实战
案例研究一
目标=多靶点激酶…
24
案例研究二
目标=抗病毒药物候选分子的多目标优化 · 毒性 · 代谢稳定性与可合成性权衡
案例研究二
目标=抗病毒药物…
25
案例研究三
目标=中枢神经系统药物多目标优化 · 靶点亲和力 · 脱靶效应与代谢稳定性
案例研究三
目标=
26
多目标分子优化中的可解释性与因果推断
目标=特征重要性 · 反事实分析 · 因果模型辅助决策与优化
多目标分子优化
可解释性
27
多目标分子优化平台与工具链
目标=RDKit · DeepChem · OpenMM
多目标分子优化平…
工具链
28
多目标分子优化中的并行与分布式计算
目标=大规模候选评估 · GPU加速 · 集群调度与优化效率提升
多目标分子优化
并行
29
多目标分子优化的评估基准与竞赛
目标=MolOpt · GuacaMol · PMO等基准任务
多目标分子优化的…
竞赛
30
前沿趋势与工程挑战
目标=大语言模型 · 多模态数据 · 自动化实验室
前沿趋势
工程挑战
所属VIP或分类
同VIP:分子蛋白多模态建模工程
同VIP:分子骨架跃迁设计工程
同VIP:生成分子合成可行性评估工程