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药物分子结构约束生成工程

共计 30 章节
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01
药物分子结构约束生成工程导论
目标=定义 · 目标 · 核心挑战与典型应用场景
药物分子结构约束…目标=定义
02
分子表示与约束基础
目标=SMILES · SELFIES · 分子图
分子表示约束基础
03
药物分子约束类型解析
目标=骨架约束 · 官能团约束 · 药效团约束
药物分子约束类型…目标=骨架约束
04
约束生成模型架构概览
目标=自回归模型 · 变分自编码器 · 生成对抗网络
约束生成模型架构…目标=自回归模型
05
约束编码与条件注入机制
目标=条件向量 · 交叉注意力 · 前缀提示与图条件融合
约束编码条件注入机制
06
基于骨架约束的分子生成实战
目标=从给定母核出发生成可合成类似物
基于骨架约束的分…目标=从给定母核…
07
基于官能团约束的分子生成实战
目标=保留或引入特定官能团的生成策略…
基于官能团约束的…目标=保留或引入…
08
基于药效团约束的分子生成实战
目标=三维药效团匹配与生成模型条件设…
基于药效团约束的…目标=三维药效团…
09
基于理化性质约束的分子生成实战
目标=LogP · TPSA · 溶解度
基于理化性质约束…LogP
10
基于ADMET约束的分子生成实战
目标=吸收 · 分布 · 代谢
ADMET基于
11
多约束联合生成策略
目标=约束优先级 · 冲突消解 · 加权采样与帕累托优化
多约束联合生成策…目标=约束优先级
12
约束满足度评估与指标
目标=有效性 · 唯一性 · 新颖性
约束满足度评估指标
13
合成可及性约束生成
目标=逆合成规划 · 反应规则与可合成性评分集成
合成可性约束生成
14
3D构象约束生成
目标=距离几何 · 对接姿态与构象生成模型的条件控制
3D构象约束生成目标=距离几何
15
基于蛋白质口袋约束的分子生成
目标=口袋特征提取 · 条件扩散与生成对接闭环
基于蛋白质口袋约…目标=口袋特征提…
16
约束生成中的强化学习与优化
目标=策略梯度 · 奖励设计 · 约束满足与探索利用平衡
约束生成强化学习
17
约束生成中的贝叶斯优化与主动学习
目标=样本高效搜索与实验反馈闭环
约束生成贝叶斯优化
18
约束生成模型训练技巧
目标=数据增强 · 课程学习 · 负样本构造与损失函数设计
约束生成模型训练…目标=数据增强
19
约束生成模型推理与采样
目标=温度调节 · 约束引导 · 拒绝采样与束搜索
约束生成模型推理采样
20
约束生成工程中的数据处理
目标=分子清洗 · 标准化 · 约束标注与数据集构建
约束生成工程数据处理
21
约束生成工程中的模型评估与验证
目标=离线指标 · 湿实验验证与迭代改进
约束生成工程模型评估
22
约束生成工程中的可解释性与可视化
目标=注意力图 · 约束归因与生成轨迹分析
约束生成工程可解释性
23
约束生成工程中的鲁棒性与分布外泛化
目标=约束偏移 · 噪声条件与对抗测试
约束生成工程鲁棒性
24
约束生成工程中的计算资源与效率优化
目标=批处理 · 缓存 · 分布式训练与推理加速
约束生成工程计算资源
25
约束生成工程中的失败模式与调试
目标=约束违反 · 模式崩溃 · 无效分子与修复策略
约束生成工程失败模式
26
约束生成工程中的知识产权与合规
目标=专利约束 · 法规限制与生成分子新颖性边界
约束生成工程知识产权
27
约束生成工程实战项目一
目标=针对特定靶点的骨架跃迁与多约束…
约束生成工程实战…目标=针对特定靶…
28
约束生成工程实战项目二
目标=从活性数据出发的ADMET约束…
约束生成工程实战…ADMET
29
约束生成工程实战项目三
目标=基于口袋约束的3D分子生成与对…
约束生成工程实战…目标=基于口袋约…
30
约束生成工程前沿与展望
目标=大语言模型 · 多模态生成 · 自动化实验闭环与工业落地
约束生成工程前沿目标=大语言模型