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疾病靶点关联分析工程

共计 30 章节
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01
疾病靶点关联分析工程导论
目标=课程定位 · 核心问题 · 工程化流程与交付物标准
疾病靶点关联分析…目标=课程定位
02
疾病与靶点数据来源
目标=OMIM · DisGeNET · Open Targets
疾病靶点数据来源
03
靶点标识与映射工程
目标=基因 ID · 蛋白 ID · UniProt
靶点标识映射工程
04
疾病本体与表型标准化
目标=ICD · MeSH · DO
疾病本体表型标准化
05
数据质量评估与清洗
目标=缺失值 · 重复记录 · 矛盾证据
数据质量评估清洗
06
关联证据类型与证据分级
目标=遗传关联 · 表达关联 · 通路关联
关联证据类型证据分级
07
基于公共数据库的靶点-疾病关联提取实战
目标=从 Open Targets…
基于公共数据库的…疾病关联提取实战
08
文献挖掘与知识发现
目标=PubMed 摘要抽取 · 共现网络 · 语义关系识别与人工校验流程
文献挖掘知识发现
09
基因表达谱与差异分析
目标=GEO · TCGA 数据预处理 · 差异表达基因识别与疾病相关性初筛
基因表达谱差异分析
10
遗传关联分析基础
目标=GWAS 汇总统计 · eQTL · 共定位分析在靶点关联中的应用
遗传关联分析基础GWAS
11
网络药理学与靶点关联
目标=构建疾病-靶点-药物网络 · 识别关键节点与模块
网络药理学靶点关联
12
蛋白质-蛋白质相互作用网络
目标=STRING · BioGRID 数据整合与疾病模块发…
蛋白质蛋白质相互作用网…
13
通路与功能富集分析
目标=GO · KEGG · Reactome 富集结果解读与靶点…
通路功能富集分析
14
关联评分模型设计
目标=从简单打分到逻辑回归 · 随机森林 · 贝叶斯网络的工程实现
关联评分模型设计目标=从简单打分…
15
机器学习在靶点关联预测中的应用
目标=特征工程 · 正负样本构建 · 模型评估与可解释性
机器学习靶点关联预测
16
图神经网络与知识图谱
目标=构建疾病-靶点知识图谱 · 实现链接预测与关联推理
图神经网络知识图谱
17
靶点可成药性与安全性评估
目标=可成药基因组 · 组织特异性 · 毒性预测与脱靶风险
靶点可成药性安全性评估
18
疾病靶点关联分析流程自动化
目标=Snakemake/Nextf…
疾病靶点关联分析…Snakemake/Ne…
19
关联分析结果的可视化
目标=网络图 · 热图 · 火山图
关联分析结果的可…目标=网络图
20
案例实战一
目标=肿瘤疾病靶点关联分析全流程——…
案例实战一目标=肿瘤疾病靶…
21
案例实战二
目标=神经退行性疾病靶点关联分析——…
案例实战二目标=神经退行性…
22
案例实战三
目标=罕见病靶点关联分析——小样本 · 多源证据与专家知识融合
案例实战三目标=罕见病靶点…
23
关联结果的统计验证与假阳性控制
目标=置换检验 · FDR · Bootstrap 与交叉验证
关联结果的统计验…假阳性控制
24
实验验证策略设计
目标=CRISPR 筛选 · RNAi · 类器官
实验验证策略设计CRISPR
25
靶点关联分析在药物重定位中的应用
目标=老药新用 · 适应症扩展与联合用药预测
靶点关联分析药物重定位
26
工程化部署与可重复性
目标=容器化 · 版本控制 · 数据版本管理（DVC）与 CI/CD
工程化部署可重复性
27
关联分析平台的 API 设计与微服务架构
目标=查询接口 · 任务队列与结果缓存
API关联分析平台的
28
隐私、伦理与合规
目标=数据使用协议 · 患者隐私保护 · GDPR 与 HIPAA 要点
隐私伦理
29
前沿进展与挑战
目标=单细胞多组学 · 空间转录组 · AI 生成模型在靶点关联中的探索
前沿进展挑战
30
课程总结与项目答辩
目标=综合项目设计 · 成果展示 · 评审标准与持续学习路径
课程总结项目答辩