VIP14
本课程属于：029-药物知识图谱靶点发现与重定位工程 生命科学与数字医疗 · 共 14 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

多组学靶点发现工程

共计 30 章节
可可资料掘金营 · 点击在线试看
01
多组学靶点发现工程导论
目标=定义多组学靶点发现工程的核心目… · 技术栈与工程化流程 · 区分其与单组学靶点筛选的差异
多组学靶点发现工…目标=定义多组学…
02
靶点发现的问题定义与可计算化
目标=将疾病生物学问题转化为可计算的… · 明确输入输出 · 成功指标
靶点发现的问题定…可计算化
03
多组学数据模态与公共资源
目标=系统梳理基因组 · 转录组 · 蛋白质组
多组学数据模态公共资源
04
多组学数据获取与质量控制
目标=设计数据下载 · 版本管理 · 元数据整合与质控流水线
多组学数据获取质量控制
05
多组学数据预处理与标准化
目标=针对不同组学平台实施归一化 · 批次校正 · 缺失值插补与特征过滤
多组学数据预处理标准化
06
多组学数据整合策略总览
目标=对比早期 · 中期 · 晚期整合与联合嵌入
多组学数据整合策…目标=对比早期
07
基于矩阵分解与降维的整合
目标=使用PCA · NMF · CCA
基于矩阵分解降维的整合
08
基于图与网络的整合
目标=构建样本相似图 · 特征关联图与多层网络 · 应用图嵌入
基于图网络的整合
09
基于深度学习的多组学整合
目标=设计自编码器 · 变分自编码器 · 对比学习与多模态Transforme…
基于深度学习的多…目标=设计自编码…
10
差异表达与差异丰度分析工程
目标=实现跨组学差异分析流水线 · 控制多重检验 · 效应量与协变量
差异表达差异丰度分析工程
11
共表达与调控网络推断
目标=从转录组 · 蛋白质组与表观组推断共表达模块 · 转录因子调控网络与信号通路活性
共表达调控网络推断
12
因果推断与孟德尔随机化
目标=利用遗传变异作为工具变量 · 结合eQTL · pQTL与GWAS进行因果靶点筛选
因果推断孟德尔随机化
13
多组学关联分析
目标=实施eQTL · pQTL · mQTL
多组学关联分析eQTL
14
通路与功能富集工程
目标=构建通路 · GO · 疾病本体与蛋白互作网络富集流水线
通路功能富集工程
15
靶点可成药性与安全性评估
目标=整合药物靶点数据库 · 可成药基因组 · 组织特异性表达与毒性数据
靶点可成药性安全性评估
16
靶点优先级排序与多准则决策
目标=设计打分函数与排序模型 · 融合证据强度 · 可重复性
靶点优先级排序多准则决策
17
机器学习驱动的靶点分类与预测
目标=构建监督与半监督模型 · 利用多组学特征预测靶点-疾病关联 · 药物响应与临床终点
机器学习驱动的靶…预测
18
网络药理学与多靶点干预
目标=从多组学网络出发识别模块化靶点… · 分析协同作用 · 合成致死与联合用药策略
网络药理学多靶点干预
19
单细胞多组学与靶点发现
目标=利用scRNA-seq · scATAC-seq与空间转录组解析… · 处理稀疏性
单细胞多组学靶点发现
20
空间多组学与微环境靶点
目标=整合空间转录组 · 空间蛋白质组与成像数据 · 发现肿瘤微环境
空间多组学微环境靶点
21
多组学靶点发现中的统计与机器学习验证
目标=设计交叉验证 · 置换检验 · 独立队列验证与嵌套交叉验证
多组学靶点发现统计
22
实验验证与功能基因组学
目标=规划CRISPR筛选 · RNAi · 过表达
实验验证功能基因组学
23
临床样本与队列验证
目标=利用患者队列 · 液体活检与临床终点数据验证靶点表达 · 变异与预后关联
临床样本队列验证
24
靶点发现的可重复性与报告规范
目标=遵循FAIR原则 · 版本控制 · 容器化与工作流管理
靶点发现的可重复…报告规范
25
多组学靶点发现平台与工具链
目标=搭建Nextflow · Snakemake · CWL等流程
多组学靶点发现平…工具链
26
案例实战一
目标=肿瘤多组学靶点发现 · 完成整合分析 · 候选靶点排序与可成药性评估
案例实战一目标=肿瘤多组学…
27
案例实战二
目标=免疫与炎症疾病靶点发现 · eQTL · 单细胞与蛋白质组数据
案例实战二目标=免疫
28
案例实战三
目标=神经退行性疾病多组学靶点 · 遗传风险与网络模型 · 发现早期诊断与干预候选靶点
案例实战三目标=神经退行性…
29
靶点发现项目的工程管理与协作
目标=定义里程碑 · 数据治理 · 角色分工
靶点发现项目的工…协作
30
前沿趋势与课程综合项目
目标=跟踪多模态基础模型 · 空间多组学 · 扰动图谱与AI驱动靶点发现前沿
前沿趋势课程综合项目