VIP10
本课程属于：028-蛋白结构预测与序列智能工程 生命科学与数字医疗 · 共 10 门相关课程，组合学习更完整。
查看所属VIP全部课程 →
← 返回所属目录 咨询 / 购买

蛋白突变效应预测工程

共计 30 章节
可可资料掘金营 · 点击在线试看
01
蛋白突变效应预测工程导论
目标=课程定位 · 核心问题 · 工程化流程与典型应用场景
蛋白突变效应预测…目标=课程定位
02
蛋白质序列与结构数据基础
目标=氨基酸理化性质 · 突变表示 · PDB与UniProt数据获取与清洗
蛋白质序列结构数据基础
03
突变效应标签体系
目标=适应度 · 稳定性 · 致病性
突变效应标签体系目标=适应度
04
数据划分与泄漏控制
目标=同源划分 · 位置划分 · 突变类型划分及工程中的评估陷阱
数据划分泄漏控制
05
序列特征工程
目标=独热编码 · k-mer · 进化保守性
序列特征工程目标=独热编码
06
结构特征工程
目标=溶剂可及性 · 二级结构 · 接触图
结构特征工程目标=溶剂可
07
进化信息特征
目标=MSA构建 · 保守性打分 · 共进化信号与突变效应先验知识融合
进化信息特征MSA
08
基线预测模型
目标=线性回归 · 随机森林 · 梯度提升树在突变效应预测中的实现与调…
基线预测模型目标=线性回归
09
深度学习序列模型
目标=CNN · RNN · Transformer在蛋白突变效应…
深度学习序列模型CNN
10
图神经网络与结构建模
目标=残基图构建 · 消息传递 · 几何图神经网络预测突变效应
图神经网络结构建模
11
蛋白质语言模型微调
目标=ESM · ProtBert等模型在下游突变效应…
蛋白质语言模型微…ESM
12
多模态融合策略
目标=序列 · 结构 · 进化与文本知识融合的架构设计与消融实…
多模态融合策略目标=序列
13
突变效应预测中的迁移学习
目标=跨蛋白 · 跨物种 · 跨突变类型迁移与领域自适应
突变效应预测迁移学习
14
小样本与零样本预测
目标=少样本学习 · 元学习 · 提示学习在稀有突变场景中的应用
小样本零样本预测
15
不确定性量化与置信度评估
目标=贝叶斯方法 · 集成学习 · 共形预测与工程决策支持
不确定性量化置信度评估
16
模型可解释性工程
目标=注意力可视化 · SHAP · 突变位点归因与生物学假设生成
模型可解释性工程目标=注意力可视…
17
稳定性突变预测实战
目标=以热稳定性 · 折叠稳定性为目标的端到端建模与验证
稳定性突变预测实…目标=以热稳定性
18
致病性突变预测实战
目标=临床变异解读 · ACMG指南对接与致病性打分系统构建
致病性突变预测实…目标=临床变异解…
19
功能活性突变预测实战
目标=酶活性 · 结合亲和力 · 信号通路影响的预测与实验闭环
功能活性突变预测…目标=酶活性
20
多突变与上位效应预测
目标=组合突变 · 协同/拮抗效应建模与组合空间搜索策略
多突变上位效应预测
21
定向进化与蛋白质工程应用
目标=预测指导的突变文库设计 · 筛选策略与迭代优化
定向进化蛋白质工程应用
22
模型评估与基准测试
目标=Spearman · NDCG · AUC等指标
模型评估基准测试
23
工程化部署与API服务
目标=模型序列化 · 推理加速 · RESTful API与批量预测流水…
API工程化部署
24
高通量计算与并行化
目标=GPU加速 · 分布式推理 · 任务调度与大规模突变扫描
高通量计算并行化
25
数据与模型版本管理
目标=DVC · MLflow · 模型注册
数据模型版本管理
26
主动学习与实验设计
目标=预测不确定性驱动的突变选择与湿…
主动学习实验设计
27
领域前沿与挑战
目标=零样本预测 · 全原子模型 · 生成式设计对突变效应预测的影响
领域前沿挑战
28
伦理、安全与合规
目标=双用途研究 · 生物安全 · 数据隐私与负责任创新
伦理安全
29
课程项目实战（一）
目标=选题 · 数据准备 · 基线模型搭建与初步评估
课程项目实战目标=选题
30
课程项目实战（二）
目标=模型优化 · 结果解读 · 报告撰写与项目答辩
课程项目实战目标=模型优化