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018-医疗数据分析与临床队列工程
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《SQL临床研究队列构建工程》
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本课程属于:018-医疗数据分析与临床队列工程
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📘
SQL临床研究队列构建工程
共计 30 章节
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01
临床研究队列构建工程导论
目标=队列研究设计类型 · SQL在真实世界数据中的角色 · 从研究问题到可执行SQL的工程化思维
临床研究队列构建…
目标=队列研究设…
02
临床数据模型与SQL映射
目标=电子病历 · 登记库 · claims 数据的常见表结构
SQL
临床数据模型
03
队列定义要素的SQL表达
目标=入组标准 · 排除标准 · 索引日期
SQL
队列定义要素的
04
患者主索引与去重工程
目标=跨系统患者标识映射 · 重复记录识别 · ROW_NUMBER与窗口函数在患者…
患者主索引
去重工程
05
诊断编码队列构建
目标=ICD-9/10 · SNOMED等编码体系 · 诊断表结构解析
诊断编码队列构建
ICD-9/10
06
药品暴露队列构建
目标=处方与医嘱表结构 · 药品通用名/商品名/RxNorm标准… · 暴露定义
药品暴露队列构建
目标=处方
07
检验与生命体征队列构建
目标=LOINC编码 · 结果值单位转换 · 异常值处理
检验
生命体征队列构建
08
手术与操作队列构建
目标=ICD-9-CM/ICD-10… · 手术日期提取 · 多源操作记录的合并与优先级规则
手术
操作队列构建
09
索引日期确定工程
目标=以首次诊断 · 首次用药 · 手术日期或随机日期为索引
索引日期确定工程
目标=以首次诊断
10
基线特征表构建
目标=人口学 · 合并症 · 用药
基线特征表构建
目标=人口学
11
随访时间与结局事件计算
目标=生存时间 · 删失 · 事件发生日期的SQL推导
随访时间
结局事件计算
12
时间窗口与观察期工程
目标=洗脱期 · 暴露窗口 · 结局窗口
时间窗口
观察期工程
13
多表关联与集合运算
目标=INNER JOIN · LEFT JOIN · FULL JOIN
多表关联
集合运算
14
窗口函数进阶队列计算
目标=LAG/LEAD · FIRST_VALUE · LAST_VALUE
窗口函数进阶队列…
LAG/LEAD
15
递归查询与层级数据
目标=CTE递归处理就诊链 · 转科 · 上下级诊断
递归查询
层级数据
16
队列匹配与对照选择
目标=倾向性评分匹配 · 精确匹配 · 粗化精确匹配的SQL实现
队列匹配
对照选择
17
随机抽样与样本量控制
目标=分层抽样 · 整群抽样 · 系统抽样的SQL方法
随机抽样
样本量控制
18
数据质量与缺失值工程
目标=完整性 · 一致性 · 及时性检查
数据质量
缺失值工程
19
异常值与离群值处理
目标=临床合理范围校验 · Winsorize · 截断
异常值
离群值处理
20
队列版本管理与可重复构建
目标=SQL脚本版本控制 · 参数化模板 · ETL流水线
队列版本管理
可重复构建
21
性能优化与大数据队列
目标=索引策略 · 分区表 · 临时表
性能优化
大数据队列
22
多中心队列的联邦查询
目标=分布式SQL · 跨库JOIN · 数据脱敏
心队列的联邦查询
SQL
23
真实世界案例一
目标=2型糖尿病新用药者队列——从研… · 暴露定义与基线表
真实世界案例一
目标=2型糖尿病…
24
真实世界案例二
目标=心力衰竭住院患者30天再入院队… · 结局判定与随访窗口的SQL工程
真实世界案例二
目标=心力衰竭住…
25
真实世界案例三
目标=肿瘤免疫治疗响应队列——治疗线 · 联合用药 · 疗效评估与生存结局的SQL构建
真实世界案例三
目标=肿瘤免疫治…
26
真实世界案例四
目标=围手术期并发症队列——手术编码 · 并发症时间窗 · 风险调整变量的SQL提取
真实世界案例四
目标=围手术期并…
27
队列验证与敏感性分析
目标=阳性对照 · 阴性对照 · E值
队列验证
敏感性分析
28
从SQL队列到统计分析数据集
目标=宽表与长表转换 · 变量标签 · 导出SAS/R/Stata格式的工程…
SQL
队列到统计分析数…
29
队列文档与监管合规
目标=CDISC · OMOP CDM · FDA/EMA真实世界证据指南
队列文档
监管合规
30
综合实战
目标=完整临床研究队列构建项目——需… · SQL模块设计 · 代码评审
综合实战
目标=完整临床研…
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