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018-医疗数据分析与临床队列工程
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《Python临床分析报告自动化》
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本课程属于:018-医疗数据分析与临床队列工程
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Python临床分析报告自动化
共计 30 章节
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01
临床分析报告自动化的需求与场景
目标=梳理临床研究报告 · 检验报告 · 统计报表的典型结构与人工撰写痛点
临床分析报告自动…
场景
02
Python临床数据读取与整合
目标=使用pandas读取CSV · Excel · SAS
Python
临床数据读取
03
临床数据清洗与标准化
目标=基于CDISC SDTM/AD… · 类型转换 · 单位统一
临床数据清洗
标准化
04
描述性统计表自动生成
目标=用pandas与numpy计算… · 中位数 · 频数
描述性统计表自动…
pandas
05
统计检验结果自动化
目标=封装t检验 · 卡方检验 · Fisher精确检验
统计检验结果自动…
目标=封装t检验
06
生存分析报告自动化
目标=使用lifelines或sci… · 中位生存期 · Cox回归结果并结构化输出
生存分析报告自动…
lifelines
07
临床图表批量生成
目标=用matplotlib与sea… · 森林图 · KM曲线
临床图表批量生成
matplotlib
08
Word报告模板化生成
目标=使用python-docx创建… · 段落 · 表格
Word
报告模板化生成
09
Excel报告自动化输出
目标=用openpyxl或xlsxw… · 条件格式 · 公式与图表
Excel
报告自动化输出
10
PDF报告生成与合并
目标=使用reportlab或wea… · 批量合并多个受试者或中心报告
PDF
报告生成
11
Jinja2模板引擎在报告中的应用
目标=设计可复用的报告模板 · 分离数据与呈现逻辑 · 动态渲染文本
Jinja2
模板引擎
12
临床报告中的表格样式与格式化
目标=实现小数点位数 · 千分位 · 百分比
临床报告
表格样式
13
自动化报告中的图表嵌入与题注
目标=将生成的统计图按章节插入Wor… · 自动编号 · 添加题注与交叉引用
自动化报告
图表嵌入
14
多中心临床报告批量生成
目标=按中心 · 受试者或访视循环生成独立报告 · 处理文件命名
心临床报告批量生…
目标=按
15
临床报告自动化中的参数化配置
目标=使用YAML/JSON/INI… · 变量列表 · 输出路径与报告选项
临床报告自动化
参数化配置
16
临床数据质量核查报告
目标=自动检查缺失值 · 离群值 · 逻辑矛盾
临床数据质量核查…
目标=自动检查缺…
17
不良事件与合并用药汇总表
目标=按MedDRA或WHODrug… · 例次 · 严重程度
不良事件
合并用药汇总表
18
实验室检查异常值报告
目标=基于CTCAE分级或参考范围标… · 生成实验室检查前后对比与异常列表
实验室检查异常值…
CTCAE
19
疗效分析报告自动化
目标=针对连续终点 · 分类终点 · 时间事件终点
疗效分析报告自动…
目标=针对连续终…
20
临床报告中的交叉引用与目录
目标=自动生成目录 · 图表索引 · 页码与超链接
临床报告
交叉引用
21
报告自动化流水线设计
目标=用函数与类组织数据读取 · 分析 · 绘图
报告自动化流水线…
目标=用函数
22
临床报告自动化中的错误处理与日志
目标=捕获数据异常 · 模板缺失 · 输出失败
临床报告自动化
错误处理
23
报告版本控制与审计追踪
目标=记录数据版本 · 代码版本 · 参数快照与生成时间
报告版本控制
审计追踪
24
临床报告自动化中的敏感数据脱敏
目标=对受试者标识 · 姓名 · 日期等进行掩码或哈希处理
临床报告自动化
敏感数据脱敏
25
交互式临床分析报告
目标=使用Jupyter Noteb… · Voila或Streamlit将分析… · 支持筛选与下钻
交互式临床分析报…
Jupyter
26
临床报告自动化中的单元测试
目标=对统计计算 · 表格生成 · 图表输出编写pytest测试
临床报告自动化
单元测试
27
临床报告模板的模块化与复用
目标=将页眉 · 页脚 · 签名页
临床报告模板的模…
复用
28
从SAS到Python的临床报告迁移
目标=对比SAS ODS与Pytho… · 迁移已有统计表 · 图与宏逻辑
SAS
Python
29
真实临床研究案例端到端实战
目标=从原始数据到最终Word/PD… · 完成数据清洗 · 统计分析
真实临床研究案例…
Word/PD
30
临床报告自动化项目的部署与交付
目标=打包脚本 · 配置环境 · 编写使用说明
临床报告自动化项…
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同VIP:Python临床数据分析工程
同VIP:Python临床研究队列工程
同VIP:Python医疗数据可视化工程