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自动化菌株构建与筛选工程

共计 30 章节
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01
自动化菌株工程导论
目标=自动化菌株构建与筛选的定义 · 技术栈 · 发展历程
自动化菌株工程导…目标=自动化菌株…
02
底盘细胞与遗传操作基础
目标=常用底盘细胞（大肠杆菌 · 枯草芽孢杆菌 · 酵母等）的遗传特性
底盘细胞遗传操作基础
03
自动化基因编辑工具选型
目标=CRISPR/Cas · 碱基编辑 · Prime编辑
自动化基因编辑工…CRISPR/Cas
04
DNA元件与构建体设计
目标=启动子 · RBS · 终止子
DNA元件
05
自动化DNA组装与转化
目标=Golden Gate · Gibson · Gateway等方法的液体处理工作站…
DNA自动化
06
菌株构建的液体处理自动化平台
目标=工作站硬件架构 · 移液精度 · 耗材选择
菌株构建的液体处…目标=工作站硬件…
07
自动化菌株构建的实验设计
目标=从靶点到构建体的层级化设计 · 引物设计自动化 · 构建体序列验证与错误率控制
自动化菌株构建的…目标=从靶点到构…
08
高通量菌株构建流程集成
目标=从DNA到菌株的端到端自动化流… · 调度逻辑与样本追踪
高通量菌株构建流…DNA
09
自动化筛选的检测原理
目标=光密度 · 荧光 · 吸光度
自动化筛选的检测…目标=光密度
10
高通量筛选策略设计
目标=基于生长 · 荧光 · 酶活
高通量筛选策略设…目标=基于生长
11
自动化筛选平台搭建
目标=液体处理工作站 · 读板机 · 机械臂
自动化筛选平台搭…目标=液体处理工…
12
微流控与液滴筛选技术
目标=液滴微流控 · 微腔阵列 · 单细胞分选在自动化菌株筛选中的原理与…
微流控液滴筛选技术
13
流式细胞术与分选自动化
目标=荧光激活细胞分选 · 微流控分选与自动化菌株库筛选的联用策…
流式细胞术分选自动化
14
自动化菌株库构建与管理
目标=突变库 · CRISPR库 · 启动子库的自动化构建
自动化菌株库构建管理
15
自动化筛选中的数据采集
目标=板读数据 · 图像数据 · 时序数据的自动采集
自动化筛选数据采集
16
筛选数据的预处理与质量控制
目标=背景扣除 · 归一化 · 异常值检测
筛选数据的预处理质量控制
17
机器学习辅助菌株筛选
目标=分类 · 回归 · 聚类
机器学习辅助菌株…目标=分类
18
自动化构建与筛选的闭环优化
目标=设计-构建-测试-学习循环的自… · 贝叶斯优化与实验调度
自动化构建筛选的闭环优化
19
自动化菌株构建中的质量控制
目标=构建体测序验证 · 菌落PCR · 限制性酶切
自动化菌株构建质量控制
20
自动化筛选中的污染与假阳性
目标=污染源识别 · 阴性对照设计 · 交叉污染控制与数据可信度保障
自动化筛选污染
21
自动化菌株工程的通量与成本
目标=通量瓶颈分析 · 耗材成本核算 · 设备利用率优化与规模放大策略
自动化菌株工程的…成本
22
自动化菌株构建与筛选的标准化
目标=模块化元件 · 标准化协议 · 数据格式
自动化菌株构建筛选的标准化
23
案例实战一
目标=自动化构建产酶菌株 · 筛选 · 复筛与酶活验证的完整流程
案例实战一目标=自动化构建…
24
案例实战二
目标=自动化筛选耐逆菌株：构建突变库 · 自动化培养 · 胁迫处理
案例实战二目标=自动化筛选…
25
案例实战三
目标=自动化构建代谢工程菌株 · 启动子替换 · 自动化筛选高产菌株
案例实战三目标=自动化构建…
26
案例实战四
目标=自动化菌株筛选中的机器学习应用 · 特征工程 · 模型训练与实验验证闭环
案例实战四目标=自动化菌株…
27
自动化菌株工程中的机器人集成
目标=机械臂 · 移动机器人 · 协作机器人在菌株构建与筛选中的任务规…
自动化菌株工程机器人集成
28
自动化菌株工程中的软件与调度
目标=实验设计软件 · 调度算法 · 设备驱动
自动化菌株工程软件
29
自动化菌株工程的安全与合规
目标=生物安全 · 废弃物处理 · 数据隐私
自动化菌株工程的…合规
30
课程综合项目与前沿展望
目标=学生分组完成自动化菌株构建与筛… · 并讨论合成生物学自动化未来趋势
课程综合项目前沿展望