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生物信息学与 AI 制药工程
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《matplotlib seaborn差异表达图表实战》
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matplotlib seaborn差异表达图表实战
共计 30 章节
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01
课程介绍与环境搭建
安装matplotlib · seaborn · pandas
课程介绍
环境搭建
02
Matplotlib基础
折线图与散点图 · 理解figure · axes
Matplotlib
折线图
03
Seaborn基础
样式设置 · 绘图风格(darkgrid · whitegrid等)及默认调色板
Seaborn
样式设置
04
差异表达数据简介
读取CSV/TSV格式的差异表达结果… · p-value等)
差异表达数据简介
CSV/TSV
05
数据预处理
缺失值处理 · 过滤低表达基因 · 标准化(如z-score)
数据预处理
缺失值处理
06
基础统计图
箱线图(boxplot)与直方图(h…
基础统计图
boxplot
07
火山图(Volcano Plot)绘制
散点图叠加颜色和阈值线 · 标记显著基因
Volcano
Plot
08
热图(Heatmap)绘制
seaborn.heatmap · 颜色映射与聚类选项
Heatmap
热图
09
聚类热图
结合集群树状图(clustermap…
聚类热图
clustermap
10
小提琴图(Violin Plot)
展示多组表达分布 · 结合箱线内部结构
Violin
Plot
11
点图(Stripplot)与蜂群图(Swarmplot)
展示单个样本值 · 避免重叠
Stripplot
Swarmplot
12
多组比较
分组箱线图与小提琴图 · 自定义颜色和调色板
多组比较
分组箱线图
13
相关性热图(Correlation Heatmap)
计算基因间或样本间相关性矩阵
Correlation
Heatmap
14
折线图展示表达趋势
多组均值变化曲线 · 添加误差条(errorbar)
折线图展示表达趋…
多组均值变化曲线
15
面积图与填充区域
突出表达量变化范围(使用fill_b…
面积图
填充区域
16
分组散点图与回归线
seaborn.lmplot或reg…
分组散点图
回归线
17
分面绘图(Facet Grid)
根据类别变量生成多子图矩阵(Face… · catplot)
Facet
Grid
18
自定义坐标轴与刻度
设置对数坐标 · 刻度标签旋转 · 去除脊柱
自定义坐标轴
刻度
19
图例、标题与标签美化
fontsize · 位置调整 · latex公式支持
图例
标题
20
颜色方案与调色板自定义
seaborn.color_pale… · 创建离散/连续色板
颜色方案
调色板自定义
21
保存图表
高质量图片导出(dpi · bbox_inches · 透明背景)
保存图表
dpi
22
子图布局
多图组合(subplots · GridSpec) · 共享坐标轴
子图布局
subplots
23
动图制作
使用matplotlib.anima…
动图制作
matplotlib.a…
24
交互式图表
mpld3或plotly快速转换静态…
交互式图表
mpld3
25
统计注释与显著性标记
在图上添加p-value星号 · 连线等(如statannotatio…
统计注释
显著性标记
26
简报与报告中的图表整合
调整尺寸 · 分辨率 · 嵌入LaTeX
简报
报告
27
批量生成差异表达图表
循环遍历基因列表 · 自动保存为PDF/PNG
批量生成差异表达…
循环遍历基因列表
28
常见问题与调试技巧
中文乱码 · 负号显示 · 图例重合等解决方案
常见问题
调试技巧
29
实战案例
RNA-seq差异表达分析可视化 · 热图 · GO富集图
实战案例
RNA-seq
30
课程总结与进阶资源
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课程总结
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