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本课程属于：057-RNA-seq差异表达可视化 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
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Python Dash交互式差异表达报告教程

共计 30 章节
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01
课程介绍
差异表达分析概述 · Dash框架简介 · 课程目标与前置知识
课程介绍差异表达分析概述
02
Python基础回顾
数据类型 · 控制流 · 函数定义
Python基础回顾
03
Pandas数据处理
读取CSV/Excel · 数据清洗 · 合并
Pandas数据处理
04
数据可视化基础
Matplotlib vs Plot… · Plotly基础图表类型
数据可视化基础Matplotlib
05
Plotly交互式图表
散点图 · 折线图 · 柱状图
Plotly交互式图表
06
Dash入门
安装Dash · 创建第一个App · 基本布局结构
Dash安装
07
Dash核心组件
html组件 · 核心组件（图表 · 表格
Dash核心组件
08
Dash回调基础
装饰器 · 输入输出 · 更新图表
Dash回调基础
09
多输入多输出回调
多个输入联动 · 多个输出更新
多输入多输出回调多个输入联动
10
状态与阻止更新
使用State · prevent_initial_ca…
状态阻止更新
11
差异表达数据格式
Counts矩阵 · metadata · 从公共数据库下载示例数据
差异表达数据格式Counts
12
统计分析基础
假设检验 · p值 · FDR校正（Benjamini-Ho…
统计分析基础假设检验
13
差异表达方法原理
DESeq2算法简介 · 负二项分布模型
差异表达方法原理DESeq2
14
使用Python实现差异表达
pyDESeq2库或statsmod…
Python使用
15
结果表格生成
输出差异表达结果DataFrame · 排序 · 过滤
结果表格生成DataFrame
16
交互式火山图
用Plotly绘制 · 突出显著基因 · 悬停显示基因名
交互式火山图Plotly
17
交互式MA图
M值vs A值 · 动态阈值线
MA交互式
18
交互式热图
基于显著基因表达值 · 动态聚类 · 色标调整
交互式热图基于显著基因表达…
19
多基因表达折线图
按分组显示平均表达 · 误差条
多基因表达折线图按分组显示平均表…
20
箱线图与小提琴图
展示单个基因在不同条件下的分布
箱线图小提琴图
21
布局设计
使用dbc（Dash Bootstr… · 侧边栏 · 选项卡
布局设计dbc
22
文件上传与数据处理
dcc.Upload组件 · 解析用户上传文件
文件上传数据处理
23
参数控制面板
p-value阈值 · log2 fold change阈值…
参数控制面板p-value
24
动态更新报告
根据参数实时更新所有图表和表格
动态更新报告根据参数实时更新…
25
导出功能
下载筛选后的CSV · 导出SVG/PNG图表
导出功能CSV
26
性能优化
使用@dash.callback的缓… · dcc.Store存储中间结果
性能优化dash.callbac…
27
错误处理与用户提示
捕获异常 · 显示toast或alert
错误处理用户提示
28
部署指南
本地服务器 · Heroku · Docker部署配置
部署指南本地服务器
29
综合案例实战
使用真实RNA-seq数据集构建完整…
综合案例实战RNA-seq
30
总结与进阶
常见问题 · 资源 · 拓展到单细胞或蛋白质组
进阶常见问题