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《SMILES编码入门教程》
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SMILES编码入门教程
共计 30 章节
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01
SMILES简介
发展历史 · 应用领域 · 基本概念
SMILES
简介
02
原子表示
元素符号 · 方括号表示 · 同位素
原子表示
元素符号
03
键类型
单键 · 双键 · 三键
键类型
单键
04
链结构与分支
线性链 · 圆括号分支
链结构
分支
05
环结构
数字标记环 · 环的打开与闭合
环结构
数字标记环
06
芳香性
小写字母芳香原子 · 芳香环规则
芳香性
小写字母芳香原子
07
离子与电荷
正负电荷 · 方括号内表示
离子
电荷
08
氢原子处理
显式氢 · 隐式氢规则
氢原子处理
显式氢
09
立体化学
手性中心@与@@
立体化学
手性
10
双键顺反异构
斜线/与反斜线\表示
双键顺反异构
斜线
11
特殊小环
环丙烷 · 环丁烷等表示
特殊小环
环丙烷
12
有机金属化合物
金属原子SMILES写法
有机金属化合物
SMILES
13
同位素标记
质量数前缀表示
同位素标记
质量数前缀表示
14
连接点
星号*表示连接点
连接点
星号*表示连接点
15
聚合物与重复单元
重复模式表示
聚合物
重复单元
16
常见官能团
羟基 · 羰基 · 羧基
常见官能团
羟基
17
杂环化合物
含氮 · 氧 · 硫的五元六元环
杂环化合物
含氮
18
多环及稠环
稠合环 · 桥环表示
多环
稠环
19
长链与树状分子
分支与复杂链
长链
树状分子
20
绝对构型与相对构型
R/S · E/Z标记
绝对构型
相对构型
21
同分异构体与唯一SMILES
规范SMILES
SMILES
同分异构体
22
SMILES解析原理
如何编程解析字符串
SMILES
解析原理
23
SMILES生成原理
从结构图生成字符串
SMILES
生成原理
24
SMILES验证与标准化
常用工具与库
SMILES
验证
25
扩展SMILES
Isomeric SMILES · Mapped SMILES · SMARTS
SMILES
扩展
26
SMILES在化学数据库中的应用
PubChem · ChEMBL · DrugBank
SMILES
化学数据库
27
SMILES与机器学习
分子指纹 · 图神经网络输入
SMILES
机器学习
28
SMILES的局限与挑战
不能表示配位键 · 部分立体化学
SMILES
的局限
29
与其他表示法对比
InChI · Molfiles · SDF格式
其他表示法对比
InChI
30
综合实战
常见药物分子SMILES书写与解析练…
综合实战
SMILES
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