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本课程属于：052-基因组注释特征学习任务 生物信息学与 AI 制药工程 · 共 20 门相关课程，组合学习更完整。
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GPU加速基因组注释模型训练全流程

共计 30 章节
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01
基因组注释概述与GPU加速的意义
基因组注释概述与GPU加速的意义 · 核心概念 · 实践要点
GPU基因组注释概述
02
深度学习在基因组注释中的应用
深度学习在基因组注释中的应用 · 核心概念 · 实践要点
深度学习基因组注释
03
GPU计算基础
CUDA架构与编程
GPU计算基础
04
硬件环境搭建
GPU服务器配置与驱动安装
硬件环境搭建GPU
05
数据预处理
基因组序列获取与质量控制
数据预处理基因组序列获取
06
序列编码
One-hot编码与k-mer嵌入
序列编码One-hot
07
数据增强与平衡策略
数据增强与平衡策略 · 核心概念 · 实践要点
数据增强平衡策略
08
模型架构选择
CNN · RNN与Transformer
模型架构选择CNN
09
基因组注释模型
GeneMark · Augustus与BRAKER
基因组注释模型GeneMark
10
现代方法
基于Transformer的基因组注…
现代方法Transformer
11
损失函数设计
交叉熵与自定义损失
损失函数设计交叉熵
12
评估指标
准确率 · 召回率 · F1与注释特异性
评估指标准确率
13
训练流程搭建
数据加载与批处理
训练流程搭建数据加载
14
GPU加速训练
混合精度与分布式训练
GPU加速训练
15
使用PyTorch实现基础模型
使用PyTorch实现基础模型 · 核心概念 · 实践要点
PyTorch使用
16
使用TensorFlow实现基因组注释模型
使用TensorFlow实现基因组注释模… · 核心概念 · 实践要点
TensorFlow使用
17
模型调优
学习率调度与正则化
模型调优学习率调度
18
超参数搜索
网格搜索与贝叶斯优化
超参数搜索网格搜索
19
迁移学习与预训练模型
迁移学习与预训练模型 · 核心概念 · 实践要点
迁移学习预训练模型
20
多任务学习
同时预测基因结构
多任务学习同时预测基因结构
21
长序列处理
滑动窗口与注意力机制
长序列处理滑动窗口
22
基因组组装与注释整合
基因组组装与注释整合 · 核心概念 · 实践要点
基因组组装注释整合
23
非编码RNA注释与GPU加速
非编码RNA注释与GPU加速 · 核心概念 · 实践要点
RNAGPU
24
变异检测与注释
变异检测与注释 · 核心概念 · 实践要点
变异检测注释
25
模型推理优化
TensorRT与ONNX
模型推理优化TensorRT
26
模型部署
Docker与Kubernetes
模型部署Docker
27
结果可视化与报告生成
结果可视化与报告生成 · 核心概念 · 实践要点
结果可视化报告生成
28
实际案例
原核生物基因组注释
实际案例原核生物基因组注…
29
实际案例
真核生物基因组注释
实际案例真核生物基因组注…
30
未来展望与资源推荐
未来展望与资源推荐 · 核心概念 · 实践要点
未来展望资源推荐