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BLAST结果特征构建与模型训练实战

共计 30 章节
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01
BLAST简介与应用场景
BLAST简介与应用场景 · 核心概念 · 实践要点
BLAST简介
02
BLAST结果格式解析（tabular, XML）
BLAST结果格式解析（tabular · 核心概念 · 实践要点
BLASTtabular
03
提取BLAST特征
E-value
BLAST提取
04
提取BLAST特征
score
BLAST提取
05
提取BLAST特征
identity · alignment length
BLAST提取
06
提取BLAST特征
mismatches · gaps
BLAST提取
07
提取BLAST特征
query coverage · subject coverage
BLAST提取
08
特征组合与标准化
特征组合与标准化 · 核心概念 · 实践要点
特征组合标准化
09
特征选择方法（方差阈值、互信息）
特征选择方法（方差阈值、互信息） · 核心概念 · 实践要点
特征选择方法方差阈值
10
数据集构建
正负样本定义与平衡
数据集构建正负样本定义
11
数据集划分
训练集 · 验证集 · 测试集
数据集划分训练集
12
机器学习模型选择
逻辑回归
机器学习模型选择逻辑回归
13
机器学习模型选择
随机森林
机器学习模型选择随机森林
14
机器学习模型选择
支持向量机（SVM）
机器学习模型选择SVM
15
机器学习模型选择
XGBoost
机器学习模型选择XGBoost
16
模型训练流程（scikit-learn实现）
模型训练流程（scikit-learn实… · 核心概念 · 实践要点
scikit-learn模型训练流程
17
超参数调优
GridSearch与RandomS…
超参数调优GridSearch
18
模型评估
准确率 · 召回率 · F1-score
模型评估准确率
19
模型评估
ROC曲线与AUC
模型评估ROC
20
特征重要性分析与可视化
特征重要性分析与可视化 · 核心概念 · 实践要点
特征重要性分析可视化
21
模型解释
SHAP值应用
模型解释SHAP
22
实战案例1
同源序列检测
实战案例1同源序列检测
23
实战案例2
功能域预测
实战案例2功能域预测
24
实战案例3
物种分类
实战案例3物种分类
25
使用Python脚本批量处理BLAST结果
使用Python脚本批量处理BLAST结… · 核心概念 · 实践要点
PythonBLAST
26
并行处理大规模BLAST输出（multiprocessing）
并行处理大规模BLAST输出（multi… · 核心概念 · 实践要点
BLASTmultiprocess…
27
模型部署
保存与加载（joblib/pickl…
模型部署joblib/pickl
28
模型部署
Flask API封装
模型部署Flask
29
模型部署
Docker容器化
模型部署Docker
30
总结与最佳实践
总结与最佳实践 · 核心概念 · 实践要点
最佳实践总结与最佳实践