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物种组成与功能特征构建技巧教程

共计 30 章节
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01
物种组成与功能特征概述
概念 · 应用领域 · 研究意义
物种组成功能特征概述
02
数据来源与格式
野外调查 · 文献 · 数据库(GBIF
数据来源格式
03
数据清洗与标准化
缺失值处理 · 异常值处理 · 物种名称标准化
数据清洗标准化
04
物种名录构建
APG分类系统 · 分类学核对 · 同义词处理
物种名录构建APG
05
功能特征分类
形态特征 · 生理特征 · 生活史特征等
功能特征分类形态特征
06
功能特征测量与获取
野外测量 · 实验室分析 · 文献提取
功能特征测量获取
07
功能特征数据库介绍
TRY · BIEN · LEDA等
功能特征数据库介…TRY
08
功能特征数据矩阵构建
物种×特征矩阵
功能特征数据矩阵…物种×特征矩阵
09
物种组成矩阵构建
样方×物种矩阵
物种组成矩阵构建样方×物种矩阵
10
α多样性指数
物种丰富度 · Shannon · Simpson等计算
α多样性指数物种丰富度
11
β多样性分析
Jaccard · Bray-Curtis距离 · 主坐标分析
β多样性分析Jaccard
12
功能多样性指数
FRic · FEve · FDiv
功能多样性指数FRic
13
功能空间构建
PCA · NMDS · t-SNE降维
功能空间构建PCA
14
群落加权平均(CWM)计算
特征加权平均
CWM群落加权平均
15
功能群划分
聚类分析 · 功能组识别
功能群划分聚类分析
16
零模型与随机化检验
Null model用于功能多样性显…
零模型随机化检验
17
功能冗余与互补性分析
群落组装机制
功能冗余互补性分析
18
环境梯度分析
RDA · CCA · dbRDA
环境梯度分析RDA
19
系统发育与功能特征结合
系统发育信号 · 系统发育多样性
系统发育功能特征结合
20
功能特征的种间变异与环境响应
混合模型 · 贝叶斯方法
功能特征的种间变…环境响应
21
机器学习在功能特征预测中的应用
随机森林 · 深度神经网络
机器学习功能特征预测
22
空间尺度上的物种与功能组成
空间自相关 · 地理加权回归
空间尺度上的物种功能组成
23
时间动态分析
时间序列β多样性 · 功能组成变迁
时间动态分析时间序列β多样性
24
入侵生态学中的功能特征
入侵植物特征预测
入侵生态学功能特征
25
全球变化与功能特征
气候变化 · 氮沉降影响
全球变化功能特征
26
功能特征与生态系统功能
生产力 · 分解速率 · 养分循环
功能特征生态系统功能
27
数据可视化
物种组成堆叠图 · 功能空间图 · 热图
数据可视化物种组成堆叠图
28
R语言实操
vegan包 · FD包 · picante包等
R语言实操vegan
29
Python实操
scikit-bio · pandas · numpy
Python实操
30
综合案例
从数据收集到论文发表全流程
综合案例从数据收集到论文…