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《AUC与混淆矩阵在宏基因组中应用》
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AUC与混淆矩阵在宏基因组中应用
共计 30 章节
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01
分类评估基础
混淆矩阵的定义与组成(TP · FP · FN
分类评估基础
TP
02
混淆矩阵常用指标
准确率 · 精确率 · 召回率
混淆矩阵常用指标
准确率
03
F1分数与调和平均
F1的数学含义与适用场景
F1
分数
04
ROC曲线概念
真正率与假正率的关系
ROC
曲线概念
05
AUC的定义与几何意义
曲线下面积的直观理解
AUC
的定义
06
AUC的统计性质
与Wilcoxon秩和检验的联系
AUC
的统计性质
07
宏基因组学简介
测序原理 · 物种分类与功能注释
宏基因组学简介
测序原理
08
宏基因组数据特点
高维 · 稀疏 · 不平衡问题
宏基因组数据特点
高维
09
二分类任务在宏基因组中的应用
疾病预测 · 耐药基因检测
二分类任务
宏基因组
10
多分类问题
物种丰度分类 · 功能通路识别
多分类问题
物种丰度分类
11
训练集与测试集划分
分层采样在宏基因组中的重要性
训练集
测试集划分
12
交叉验证策略
K折 · 留一法在宏基因组评估中的实践
交叉验证策略
K折
13
混淆矩阵在宏基因组中的可视化
热图 · 彩色矩阵绘制(Python实现)
混淆矩阵
宏基因组
14
混淆矩阵指标解读
宏基因组中精确率与召回率的权衡
混淆矩阵指标解读
宏基因组
15
ROC曲线绘制
Python中roc_curve函数…
ROC
曲线绘制
16
AUC计算
sklearn.metrics.ro…
AUC
计算
17
宏基因组二分类案例
预测肠道微生物是否与肥胖相关
宏基因组二分类案…
预测肠道微生物是…
18
AUC在特征选择中的应用
基于AUC的排序与筛选
AUC
特征选择
19
不平衡数据集的影响
AUC对类不平衡的鲁棒性分析
不平衡数据集的影…
AUC
20
PR曲线与AUC-PR
宏基因组中罕见事件评估的最佳选择
PR
AUC-PR
21
多分类AUC
一对多 · 一对一策略与宏平均/微平均
AUC
多分类
22
混淆矩阵与AUC联合分析
通过阈值调整优化性能
AUC
混淆矩阵
23
随机森林模型在宏基因组中的应用
特征重要性评估与混淆矩阵
随机森林模型
宏基因组
24
XGBoost模型输出与AUC评估
宏基因组分类实战
XGBoost
AUC
25
支持向量机(SVM)在宏基因组中的应用
混淆矩阵与AUC对比
SVM
支持向量机
26
模型比较方法
基于AUC和混淆矩阵的统计显著性检验…
模型比较方法
AUC
27
宏基因组数据预处理对评估的影响
归一化 · 相对丰度转换
宏基因组数据预处…
归一化
28
集成学习与模型融合
基于AUC的加权投票策略
集成学习
模型融合
29
实际项目案例
利用混淆矩阵和AUC筛选宏基因组标记…
实际项目案例
AUC
30
总结与展望
AUC与混淆矩阵在宏基因组中的未来方… · 可解释性)
AUC
混淆矩阵
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