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生物信息学与 AI 制药工程
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《文献抽取质控从入门到实战》
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文献抽取质控从入门到实战
共计 30 章节
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01
文献抽取质控概述
定义 · 目标与应用场景
文献抽取质控概述
定义
02
文献数据源类型
PDF · HTML · XML
文献数据源类型
PDF
03
文本预处理基础
清洗 · 分词 · 词性标注
文本预处理基础
清洗
04
规则基于的抽取
正则表达式基础与应用
规则基于的抽取
正则表达式基础
05
正则表达式进阶
模式匹配 · 分组 · 贪婪模式
正则表达式进阶
模式匹配
06
命名实体识别入门
NER概念与常用模型
命名实体识别入门
NER
07
基于规则NER
词典匹配 · 模式匹配实战
NER
基于规则
08
基于机器学习NER
CRF模型简介
NER
基于机器学习
09
深度学习NER
BERT与BiLSTM-CRF
NER
深度学习
10
文献结构解析
标题 · 作者 · 摘要
文献结构解析
标题
11
参考文献抽取
解析引用格式(APA · MLA等)
参考文献抽取
APA
12
图表与表格抽取
工具与方法
图表
表格抽取
13
关键词提取
TF-IDF · TextRank · 内置工具
关键词提取
TF-IDF
14
摘要生成
抽取式与生成式方法
摘要生成
抽取式
15
实体关系抽取
定义 · 常用数据集 · 模型
实体关系抽取
定义
16
属性抽取
数值 · 单位 · 时间等
属性抽取
数值
17
数据标注
标注规范 · 工具(LabelStudio · BRAT)
数据标注
标注规范
18
标注质量控制
一致性检验 · Kappa系数
标注质量控制
一致性检验
19
抽取结果评估指标
精确率 · 召回率 · F1
抽取结果评估指标
精确率
20
混淆矩阵与错误分析
理解模型错误类型
混淆矩阵
错误分析
21
交叉验证与训练集/测试集划分
交叉验证与训练集/测试集划分 · 核心概念 · 实践要点
交叉验证
训练集
22
质控流程设计
从数据到模型迭代
质控流程设计
从数据到模型迭代
23
阈值调优
选择最佳决策边界
阈值调优
选择最佳决策边界
24
异常检测
识别异常抽取结果
异常检测
识别异常抽取结果
25
批量处理与并行化
提高效率
批量处理
并行化
26
API与集成
将抽取服务封装成接口
API
集成
27
实战项目一
从学术PDF抽取标题 · 作者 · 摘要
实战项目一
PDF
28
实战项目二
抽取药物-疾病关系并质控
实战项目二
抽取药物
29
实战项目三
抽取法律条款中的日期和金额
实战项目三
抽取法律条款
30
课程总结
最佳实践与未来方向
课程总结
最佳实践
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